适合新手：Jalview 多序列比对显示序列标识（超详细）

1.文件下载

安装前请先下载安装Java，下载完成后全部默认安装即可。进入界面，按照自己的电脑选择，然后直接下载就可以了

Download - Jalviewhttps://www.jalview.org/download/

2.fasta 文件打开及分析

Jalview 软件只能打开fasta 格式，所以，你的txt文件或fasw文件可以直接改成fasta格式，更开后不会影响你的文件阅读（即更改后，记事本依旧能正常打开）。我的序列是aligment处理后的（可以用maga aligment处理,或在线网址进行aligment处理），

2.1 一般图片上不会展示下方的柱形图，我们可以删除

 2.2有些部分不需要自己再去处理，我们可以不用管他

2.3 重点讲解color及format部分：clolor部分包含三个部分

2.3.1部分一：text color,采用默认的黑色，不需要改

2.3.2 部分2颜色

 2.3.3 部分3：

2.4 Formats是调节图片展示方式的包含分行显示，字体大小，字体类型

最后图片的导出，每行显示多少，通过调节展示框来调节