数据科学工厂-优快云博客

原创 R中单细胞RNA-seq分析教程 (7)

其中一个概念是，如果存在一个包含多个样本的参考数据集，并且这些样本间的差异能够反映出样本中细胞类型的异质性，那么通过将每个细胞与这些参考样本的转录组相似性作为表示，而不是直接使用其转录组轮廓，可以有效地过滤掉技术噪声，同时保留关键信息。与使用外部参考数据集通过相似性来表示数据中的细胞不同，CSS 首先对每个待整合的单细胞 RNA 测序样本进行细胞聚类，然后使用这些聚类得到的平均表达谱作为参考，来计算相似性。）定义了聚类的分辨率。遗憾的是，这两个参数并没有对应的 Seurat 包装函数，或者需要使用独立的。

2025-01-01 17:29:26 1119

原创使用 pyenv 来管理多个 Python 版本(2)

实际上，如果你愿意，可以继续沿用你现有的工作流程，尽管我认为在需要在不同环境之间切换且这些环境要求不同 Python 版本时，pyenv-virtualenv 能提供更流畅的体验。如果你查看这个环境提供的任何可执行文件，你会发现它们的情况都是相同的。同时，你也可以无忧地测试最新版本的 Python，不必担心破坏你的开发环境，这都要归功于一个强大的工具：pyenv。好消息是，由于你使用了 pyenv-installer 脚本来安装 pyenv，你已经安装好了 pyenv-virtualenv，随时可以使用。

2024-12-17 21:23:35 1058

原创非编码RNA并非 “垃圾”

这项对功能性非编码RNA的调查增进了我们对人类基因组的理解，并证明了专门针对RNA的CRISPR筛选的潜力——即便是那些不编码蛋白质的RNA，”纽约大学生物学副教授、纽约大学格罗斯曼医学院神经科学和生理学副教授、纽约基因组中心核心成员以及该研究的资深作者Neville Sanjana表示。相比之下，必需的lncRNA更具细胞类型特异性。研究小组还发现，关键的长非编码RNA（lncRNAs）能够调控细胞增殖的主要途径，这一途径在人类发育和癌症中都至关重要，它们的缺失可能会阻碍细胞的进程，甚至导致细胞死亡。

2024-12-15 12:52:13 674

原创 pyenv 管理多个 Python 版本(1)

即使你的系统中已经安装了 Python，安装 pyenv 也是有益的，因为它可以让你轻松体验新的语言特性，或者帮助参与使用不同 Python 版本的项目。幸运的是，如果你使用 pyenv，管理多个 Python 版本并不复杂。经过长时间的排查和搜索后，你可能会发现安装了错误的依赖版本，这让你的一天变得糟糕。如果你安装了 Python 的新版本，并且不小心将其安装到了系统空间，你可能会严重破坏操作系统的使用能力。如果你想使用 Python 的最新特性，而你使用的是 Ubuntu，例如，你可能就没那么幸运了。

2024-12-12 21:41:34 1116

原创 R中单细胞RNA-seq分析教程 (5)

由于关注的是分化和成熟过程中的整体分子变化，细胞周期的变化可能会对分析产生较大的干扰。如前所述，在 UMAP 嵌入中看到的背侧端脑细胞形成的类似轨迹的结构，很可能代表了背侧端脑兴奋性神经元的分化和成熟过程。这个过程很可能是连续的，因此将其视为一个连续的轨迹，而非不同的聚类，更为合适。首先，提取感兴趣的细胞。接下来，会重新识别这些细胞的高变基因，因为在这些细胞之间，代表背侧端脑细胞与其他细胞的差异的基因不再是有用的。为了展示沿着构建的伪时间的表达变化，带有拟合曲线的散点图通常是一种直观的方法。

2024-12-11 21:18:20 938

原创 21个Python脚本自动执行日常任务（2）

无论你是专业的程序员，还是希望简化日常工作的普通人，Python都能提供你需要的工具。Python 以其简洁的语法和功能丰富的库，几乎能够应对你抛出的任何挑战。将介绍我实际使用过的21个Python脚本，它们能帮助你自动化各种任务，特别适合那些希望在工作中节省时间、提升效率的朋友。以下是一个简单的脚本示例，它能够生成包含字母、数字和特殊字符的随机密码，长度可指定，以提高密码的安全性。Python 提供了一种高效的自动化文件整理方法，特别是对于删除或移动旧文件，以维护目录的整洁有序。

2024-12-09 17:42:34 2880 1

原创 21个Python脚本自动执行日常任务（1）

Python以其简洁的语法和功能强大的库支持，成为了编写自动化脚本的首选语言。无论你是专业的程序员，还是希望简化日常工作的普通人，Python都能提供你需要的工具。你可以利用任务计划工具，比如 Linux 的 cron 或 Windows 的 Task Scheduler，来设置这个脚本每天自动执行。将介绍我实际使用过的21个Python脚本，它们能帮助你自动化各种任务，特别适合那些希望在工作中节省时间、提升效率的朋友。这个脚本会持续运行，并在设定的时间点执行任务，例如，每天的上午10点。

2024-12-04 20:54:35 1143

原创 localhost 和 127.0.0.1 的区别

不过，localhost 是一个主机名（更易于人类阅读和理解的名称），而 127.0.0.1 是一个 IP 地址，指向的同样是你的计算机。这就像是系统在自言自语。不管你选择使用 localhost 还是 127.0.0.1，背后的网络请求机制是一致的，你的计算机都是在与自己进行通信，这对于本地测试和配置服务来说是一个非常有用的功能。当你使用 localhost 时，系统需要将其解析为 IP 地址，这通常是通过查找配置文件中的条目来完成的（例如，在 Linux 系统中的 /etc/hosts 文件）。

2024-11-30 16:08:24 831

原创数据分析的 10 个最佳 Python 库

Pandas 是一个专为数据处理和分析而生的开源库。NumPy（Numerical Python）是 Python 中进行数值计算的基础库，它能够处理大型的多维数组和矩阵，并提供了丰富的数学函数来对它们进行操作。Scikit-learn 是一个广受欢迎的 Python 机器学习库，它提供了简洁高效的工具，用于数据挖掘和数据分析，特别强调监督学习和无监督学习算法。Python 因其简洁、灵活以及功能强大的库，在数据分析界备受青睐，这些库使得Python成为了处理数据、制作图表和进行复杂分析的利器。

2024-11-27 19:19:12 1475

原创 Linux 如何更改默认 Shell

以下面的例子为例，我们首先查看用户 tecmint 的账户信息，了解他的默认登录Shell，然后将他的登录Shell从 /bin/sh 更改为 /bin/bash，操作步骤如下。在这种情况下，你可以将Shell包装指定为用户的登录Shell。在更改用户默认Shell之前，重要的是先通过执行下面的 echo 命令来确定当前正在使用的Shell，这个命令会显示出当前登录用户的Shell。要将 shell 字段的值更改为所需的 shell，只需指定 shell 的路径 (/bin/zsh)，如图所示。

2024-11-26 18:41:22 1566

原创 R 语言必备十大资源

在 edX 平台上提供的“数据科学：R 基础”课程是学习 R 的优质入门资源，这门免费课程覆盖了 R 的基础知识，并教你如何使用 R 处理、分析和可视化数据。如果你是 R 的新手或希望提升你的 R 技能，这里有一些核心资源可以助你一臂之力，无论是从基础学起还是提高现有水平，包括官方站点、知名学府和互动式学习平台。提供的约翰霍普金斯大学的 R 编程课程是数据科学专业的一部分，适合那些希望系统学习 R 的学习者。项目的官方网站是开启 R 学习之旅的首选，它提供免费的 R 软件、文档、教程和丰富的资源链接。

2024-11-25 19:32:34 703

原创解码语言：命名实体识别（NER）技术

所以，当你输入“苹果正在推出新的iPhone”，系统会知道你在谈论的是公司，而不是你的购物清单。比如，如果你想让计算机识别“巴黎”，你会给它提供巴黎作为一个城市的例子，以及它作为人名的例子。命名实体识别（NER）听起来可能很高大上，但其实它的核心是教会计算机做我们自然而然就能做的事情——理解周围的世界。在娱乐领域：Netflix和Spotify等服务通过识别演员、艺术家和流派的名字，分析你的观看或收听习惯，为你提供定制化的推荐。分析你的电子邮件：从收件箱中提取人名、日期和公司名称，以优化你的工作流程。

2024-11-24 19:04:55 740

原创 R中单细胞RNA-seq数据分析教程 (2)

总的来说，线粒体转录本百分比高的细胞可能代表处于压力状态的细胞（例如缺氧），这些细胞产生大量的线粒体，或者产生异常高数量的截短线粒体转录本。例如，表达水平低的基因以及在所有细胞中表达水平相似的基因，它们提供的信息量较少，可能会模糊不同细胞群体之间的差异。以这个数据集为例，将检测到的基因数量设定在500到5000之间，线粒体转录本百分比低于5%是一个合理的选择，但根据具体情况调整阈值也是完全可以的。正如所料，细胞中检测到的基因数量与转录本数量之间存在较强的相关性，但线粒体转录本的百分比却并非如此。

2024-11-23 14:15:07 1103

原创 Windows 用户应该知道的AppData

Local 文件夹是存放不能从你的用户资料中移动出去的文件的地方，也常用来存放那些太大而不适合与服务器同步的文件。比如，它可能包含一些运行视频游戏所需的文件或你的浏览器缓存，这些文件要么太大，要么没有必要转移到其他地方。例如，无痕浏览模式下的浏览器可能只能访问 LocalLow 文件夹，以防止它访问存储在 Local 中的常规用户数据。例如，Minecraft 将其世界文件、截图等存储在 Roaming 文件夹中，因为这些文件都可以被迁移到新设备上，并预期在那里正常工作。什么是Roaming？

2024-11-20 19:34:26 1121

原创基因组之全局互作热图可视化

是一个专为 Hi-C 数据可视化分析而设计的 Python 包。Hi-C 技术是一种能够检测染色体三维结构的实验方法，它能揭示 DNA 在细胞核内的三维组织结构。为了更好地展示和解释这些复杂的数据，: 该文件用于在热图标记染色体的边界线和名称。第一列是染色体的名称，第二列是染色体的长度（这个长度是Juicebox中hi件的长度，可以从Juicebox手动确定）。: 该文件来自3d-dna，您需要选择最终的hic文件（已进行错误调整并确定染色体边界）。可以帮助用户方便地绘制Hi-C 数据的热图。

2024-11-18 19:31:59 610

原创让你的环境变量更合理

有时候在编译之前我会忘记运行 ./configure --prefix=/usr 命令，因此我把 /usr/local 设置成了指向 /usr 的符号链接（通过在 /usr 目录下执行 ln -s /usr local 命令）。在现代的操作系统中，/{bin,sbin}/ 文件夹通常是 /usr/{bin,sbin}/ 的符号链接。来说，/usr/local 文件夹没什么用，如果我编译或安装软件，我更倾向于将它们放在默认的位置。最终，/usr/sbin 可能会合并到/usr/bin，因此只需要/bin。

2024-11-15 16:33:01 363

原创如何计算目录内文件的数量

中，分享了一个关键技巧，它能够让您以一种新颖的方式使用tree工具，与传统的以树状图展示文件和目录不同。命令来计算目录下的文件和子文件夹数量是一种非常简便的方法，这个命令以其能够以树状图的形式展示文件和文件夹而广为人知。你可以参考tree的手册页，了解更多实用的选项，包括一些配置文件和环境变量，以便更深入地理解tree的工作原理。从上面的图像可以看出，在列出所有文件和子目录之后，tree会展示你指定目录下总共有多少个目录和文件。-L — 用来指定要展示的目录树的层数，在上面的例子中设置为1。

2024-11-14 15:00:01 344

原创 RNA-seq 差异分析的点点滴滴（3）

函数提供额外的参数，那么 log2 倍数变化和 Wald 测试 p 值将默认针对设计公式中的最后一个变量，如果这个变量是一个因子，那么比较将是这个变量的最新水平与参考水平之间的比较（如前所述，关于因子水平）。这两个命令等价性的一个例外情况是，当使用 contrast 参数时，如果在两组比较中，所有计数都为零（而其他组有非零计数），那么这两组的估计对数倍数变化（LFC）会被额外设置为0。提供了dds对象以及希望收缩的系数的名称或编号，其中编号指的是该系数在resultsNames(dds)中出现的顺序。

2024-11-13 21:30:20 815

原创 Python闭包|你应该知道的常见用例（下）

在 Python 编程语言中，闭包通常指的是一个嵌套函数，即在一个函数内部定义的另一个函数。基于函数的装饰器是一个函数，它接受一个函数对象作为参数，并返回另一个增加了额外功能的函数对象。可调用实例如何替代闭包掌握了这些知识后，你可以开始在你的代码中创建和使用 Python 闭包，特别是如果你对函数式编程工具感兴趣的话。这个函数返回一个闭包对象，它通过增加额外的功能来改变被装饰的输入函数对象的原有行为。在 Python 中，闭包特别有用，因为它使得你可以创建基于函数的装饰器，这是一种非常强大的功能。

2024-11-11 19:00:26 964

原创适用于 Linux 的最佳命令行下载加速器

根据其手册页，支持以下协议：DICT、FILE、FTP、FTPS、GOPHER、HTTP、HTTPS、IMAP、IMAPS、LDAP、LDAPS、POP3、POP3S、RTMP、RTSP、SCP、SFTP、SMB、SMBS、SMTP 、SMTPS、TELNET 和 TFTP。wget 提供了许多高级功能，包括支持身份验证下载、设置递归下载的深度限制、接受 URL 的正则表达式匹配、排除特定文件、从文件中批量导入 URL 等。一个更有用的示例是使用后台和递归模式，以便您可以获得目录中的所有文件和文件夹。

2024-11-10 19:53:46 825

原创 RNA-seq 差异分析的点点滴滴（1）

采用上述方法进行转录本丰度估计的好处包括：（i）这种方法能够校正样本间可能的基因长度变化（例如，由于异构体的不同使用），（ii）其中一些方法（Salmon, Sailfish, kallisto）相比需要创建和存储 BAM 文件的基于比对的方法，速度显著更快，且对内存和磁盘空间的需求更少，以及（iii）可以避免丢弃那些能够与多个具有同源序列的基因对齐的片段，从而提高检测的灵敏度。kallisto;接下来，使用适当的样本列指定文件的路径，并读取一个将转录本与该数据集的基因链接起来的表。

2024-11-08 21:24:16 790

原创 Python闭包|你应该知道的常见用例（上）

在本节中，你将了解如何利用闭包来创建工厂函数，跨函数调用保持状态，以及实现回调机制，这将使你的代码更加动态、灵活和高效。在 Python 编程语言中，闭包通常指的是一个嵌套函数，即在一个函数内部定义的另一个函数。换言之，闭包是能够捕获它们所处环境（即封闭作用域）中定义的对象的函数，这使得你可以在函数体内使用这些对象。接着，你定义了一个内部函数，该函数接受一个数字作为输入，并计算出具有所需精度的特定根。在 Python 中，闭包特别有用，因为它使得你可以创建基于函数的装饰器，这是一种非常强大的功能。

2024-11-07 20:05:56 601

原创人类进化历程：40亿年的演变之路

硬骨鱼的出现，随着时间的推移，它们的演化带来了骨骼系统的复杂变化，最终产生了“原肢”，使生物能够在陆地上行走。这一时期的主要发展变化是猿类的全天候双足行走、大脑尺寸的增加，以及先进的骨骼发展，使它们能够灵巧地制造工具和狩猎。然而，随着时间的推移，哺乳动物进化出了毛发、专门的牙齿、汗腺以调节体温，以及更高效的循环系统。原细胞逐渐演化出专门的细胞器，发展成更复杂的微生物，最终形成了真核生物——这些复杂的单细胞生物孕育出了从简单的海绵到复杂动物的多样生命形式。随着时间的推移，最早的复杂器官系统开始出现。

2024-11-05 17:33:22 730

原创单细胞分析 | 基因组区域的可视化 (2)

这可以通过ExpressionPlot()函数来实现，它的功能类似于Seurat中的VlnPlot()函数，但专门设计用来与CoveragePlot()生成的基因组轨迹图相结合。在这个示例中，为覆盖轨迹中展示的每个细胞群生成了瓦片图，而在之前的示例中，能够生成一个图表，它不仅展示了所有细胞群的总体覆盖情况，还特别展示了CD4记忆细胞和CD8效应细胞的瓦片图。接着，基因组区域会被划分成多个小区域，对每个细胞在这些小区域中的片段总数进行计数，并将这些计数结果以热图的形式展示出来。

2024-11-05 16:11:36 449

原创 6种方法打造出色的Shell脚本

进行错误处理希望确保如果脚本本身出现错误，脚本会立即退出，但如果个别分支遇到问题，也允许它继续运行。为此，在脚本中策略性地使用了选项 "set -e" 和 "set +e"。通过实施这些技术，目标是创建一个用户友好、信息丰富且健壮的shell脚本，为用户提供运行和分析基准测试的极佳体验。为了支持多次基准测试运行而不覆盖先前的结果，实现了一个系统，用于带时间戳的文件输出。清晰的错误信息对于良好的用户体验至关重要。这种方法为脚本编写者提供了细致的控制，以决定哪些错误会导致脚本退出，哪些可以用其他方式处理。

2024-11-04 16:17:31 369

原创 Python 错误处理的终极指南（下）

GUI工具包（Python标准库的一部分）：Tkinter将每个应用程序事件处理程序视为应用程序的独立小运行，并在每次调用处理程序时添加一个通用的捕获所有异常的代码块，以防止有缺陷的应用程序处理程序导致GUI崩溃。但当然，相同的应用程序在生产环境中必须坚如磐石，错误被记录，如果可行的话，通知开发者，而不向最终用户泄露任何内部或私有的错误细节。这是一个例外，证明了规则。数据库错误的恢复过程在大多数应用程序中是相同的，因此你应该让框架为你完成这些繁重的工作，而你则可以从自己应用程序代码中更简单的逻辑中获益。

2024-11-03 18:24:17 903

原创长文 | 我如何使用 git

但即便只有我一个人工作，如果我修复了一个特别难缠的bug，我也会写一个详细的提交信息。即使我是唯一一个在这个项目上工作的人，甚至如果我会永远是唯一一个在这个项目上工作的人，我也在我的副项目中使用pull requests。（我的别名，用于查看我分支上的git日志）时，我只想看到我分支上的提交。当我和别人一起工作时，我遵循的标准流程是这样的：从主分支创建一个新分支，开始工作，尽早且频繁地提交代码，及时推送更改，尽早开设一个草稿拉取请求，完成工作后，确保分支中的提交是合理的，然后请求审查并合并。

2024-10-30 21:42:11 1227

原创 Linux | Rsync 命令：16 个实际示例(下)

使用此选项不会对文件进行任何更改并显示命令的输出，如果输出显示与您想要的完全相同，那么您可以从命令中删除“--dry-run”选项并运行在终端上。这两个选项允许我们通过指定参数来包含和排除文件，这些选项帮助我们指定您想要包含在同步中的文件或目录，并排除您不想传输的文件和文件夹。在提供的示例中，rsync 将在传输过程中排除具有指定扩展名 (*.ext) 的文件，同时包含所有其他文件和目录。另外，默认情况下，rsync 仅同步更改的块和字节，如果您明确想要同步整个文件，则可以使用“-W”选项。

2024-10-27 20:03:44 1048

原创 Python 错误处理的终极指南（上）

如果你不熟悉“冒泡”这个词，它描述的是异常的一个特性。如果异常没有被捕获，一直冒泡到顶部，Python将会中断应用程序，这时你会看到一个包含错误传播路径的堆栈跟踪，这是一个非常有用的调试工具。这是必需的，因为我们已经认定这个错误是无法恢复的，所以错误之后函数的剩余部分将无法完成它们的任务，也不应该继续执行。然而，在某些应用程序中，年份信息可能是必需的，这种情况下，年份未知就构成了一个不可恢复的错误。正如上文讨论的，在Python中，通知调用者错误的推荐方式是抛出一个异常，这正是我们将要做的事情。

2024-10-26 15:02:34 895

原创单细胞 | 转录因子足迹分析

要执行足迹分析，必须首先向对象中添加Motif 信息，这包括每个Motif 的精确位置。这一过程可以通过使用“motif”和“packages”这两个包中的函数来实现。现在可以对任何已知位置信息的Motif 进行足迹分析。通常，这会涵盖基因组中所有该Motif 的实例。函数会收集所有必要的数据，并将其保存在分析结果中。在本案例中，将采用之前在轨迹构建案例中已经介绍并处理过的数据集。参数，以便只考虑那些位于分析中峰值区域内的Motif。函数来绘制这些基序的足迹图。Motif 足迹分析。

2024-10-23 21:57:50 381

原创杂文 | 为什么左撇子如此罕见？

令人惊讶的是，当你比较左撇子和右撇子尼安德特人的数量时，你会发现与今天相同的1:10的左撇子比例。科学家们在研究创造力等问题时，会加入关于用手习惯的问题，如果他们发现了一个积极的关联，他们会非常兴奋，但如果没有发现联系，他们就不会报告。他的研究发现，90%的胎儿更倾向于吸吮他们的右手拇指，这与我们在普通人群中观察到的模式一致。然而，当我们观察野外的黑猩猩时，它们的用手习惯与我们的大相径庭。左撇子的大脑结构更加多样化。“问题并不在于左撇子本身，”她解释道，“更可能的是，它反映出了一些潜在的问题。

2024-10-20 13:22:06 822

原创难懂，误点！将多线程技术应用于Python的异步事件循环

为了避免这种情况，并让所有工作线程共享同一个事件循环，我编写了一个自定义策略（实际上就是创建事件循环的机制），它允许我重用现有的事件循环。与可能会中断任务的操作系统不同，Python的事件循环不会主动中断任务，而是等待任务通过使用await语句自愿交出控制权，或者自行完成。在这个堆中，任务会根据时间戳进行排序，确保堆顶的任务总是下一个即将就绪的任务。这样，当队列为空时，工作线程可以等待（即阻塞）。值得注意的是，在Python中，每个线程都拥有自己的独立事件循环，这一点在设计多线程异步方案时必须考虑。

2024-10-18 19:13:11 732

原创单细胞分析 | Cicero+Signac 寻找顺式共可及网络

为了在Seurat（Signac工具使用的格式）和CellDataSet（Cicero工具使用的格式）之间轻松转换数据，将利用GitHub上的SeuratWrappers包提供的转换功能。既然已经计算出了每个峰值之间的共可接近性得分，现在可以利用 Cicero 工具中的 generate_ccans() 功能，将这些成对的联系整合成更广泛的共可接近网络。为了节省时间，将在这里仅用一个染色体来演示如何运行 Cicero，但同样的流程也可以用来在整个基因组中寻找共可接近网络（CCANs）。

2024-10-17 21:45:18 568

原创利用 PyTorch Lightning 搭建一个文本分类模型

该项目借助了 PyTorch 生态中的多个强大工具，例如 torch、pytorch_lightning 以及 Hugging Face 提供的 transformers，从而构建了一个强大且可扩展的机器学习流程。该模型采用 BERT（一种双向编码器表示，源自 Transformers）的简化版本作为文本表示的核心模型。它利用了 PyTorch Lightning 的 LightningDataModule，这有助于保持数据处理任务的模块化和可复用性。train.py：包含了训练循环和训练的配置。

2024-10-15 19:40:48 989

原创 Python| 如何使用 DALL·E 和 OpenAI API 生成图像(2)

如果你手头有一张图像——无论它是机器生成的还是其他来源——它与你想要的相似，但又不完全符合要求，那么你可以利用 OpenAI 的 DALL·E 2 潜在扩散模型来创建它的变体。但如果得到的图像与你要找的差不多，但又不完全一样，那么你可以通过 API 再次提交你的图像作为输入，并创建它的一些变体。最重要的是，你获得了将 API 调用整合到你的 Python 脚本中的实际经验，这使你能够将令人惊叹的图像创造功能带入你自己的应用中。你结合了提示的开头和 JSON 响应中的时间戳来生成一个独特的文件名。

2024-10-14 19:57:55 904

原创自然语言处理 (NLP) 的 5 个步骤

例如，如果一句话读作“Manhattan speaks to all its people”，紧接着的下一句话读作“It calls out to Dave”，话语整合检查第一句话的上下文以理解后一句话中的“It”指的是曼哈顿。对于你的企业来说，挑战在于了解客户和潜在客户对你的产品和服务的看法，但时间和资源的限制使得这一点难以有效实现。单词“unimaginable”包含词素“un-”（一个表示否定语境的黏着词素）、“imagine”（整个单词的自由词素根）和“-able”（一个表示词根能力的黏着词素）。

2024-10-10 21:45:27 1726

原创 Python| 如何使用 DALL·E 和 OpenAI API 生成图像(1)

您可以创建和删除密钥。如果你对 DALL·E 的强大功能感到好奇，并希望将其集成到你的 Python 项目中，那么这篇文章正是你需要的。第 8 行指定使用更新的 DALL·E 3 模型，它不仅以不同的方式处理你的提示，还支持不同的参数设置、图片尺寸和质量，与默认的 DALL·E 2 模型有所区别。如果你提供的文本提示违反了这些条款，你将收到错误提示，并且如果屡次违规，你的账户可能会被封禁。虽然 DALL·E 3 能够生成更令人印象深刻的图像，但它不允许你关闭提示重写功能，这意味着你对输出的控制会减少。

2024-10-09 19:00:50 854

原创单细胞|Signac 进行 Motif 分析

为了简化 Signac 平台上的基序分析工作，设计了一个名为 Motif 的类来存储所有必要的数据，这包括一系列位置权重矩阵（PWMs）或位置频率矩阵（PFMs），以及一个记录基序出现次数的矩阵。可以利用这个函数首先筛选出在 FindMarkers() 函数中用于比较的细胞群组里开放的峰集，作为潜在的背景峰集，然后通过 MatchRegionStats() 函数从这个更大的峰集中创建出一组与 GC 含量相匹配的峰集。选定背景峰集在寻找富集的 DNA 序列基序时，确保背景峰集的匹配性是至关重要的。

2024-10-08 20:11:25 1134

原创 Linux实践|设置静态 IP 地址

如果您是 Linux 系统管理员，那么您将需要在系统上配置网络。与可以使用动态 IP 地址的台式机不同，在服务器基础设施上，您需要设置静态 IP 地址（至少在大多数情况下）。上面的“ifcfg-eth0”代表您的网络接口 eth0。如果您的接口名为“eth1”，那么您需要编辑的文件是“ifcfg-eth1”。注意：确保打开与您的网络接口对应的文件。您可以使用 ifconfig -a 命令找到您的网络接口名称。旨在向您展示如何在最常用的 Linux 发行版上配置静态 IP 地址。您的静态 IP 地址已配置。

2024-10-07 19:33:13 875

原创关于 Python 3.13 你所需要知道的几点

由于垃圾回收本身是一个复杂的话题，们在这里不深入讨论，但简单来说，Python会跟踪一个对象被引用的次数，当引用计数降到零时，Python就知道可以安全地删除这个对象了。虽然这些更新可能不会立即改变你编写和执行 Python 代码的方式，但可以预见，随着自由线程和即时编译器（JIT）技术的不断成熟和普及，它们将在未来几个月甚至几年内，逐渐提升 Python 代码的性能，尤其是对那些需要大量 CPU 计算的任务。在关于GIL的讨论进行的同时，还有一个名为“更快的CPython”的项目在并行推进。

2024-10-06 20:33:43 1684

空空如也

空空如也