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原创 Prism和SPSS的显著性分析

Prism和SPSS的显著性分析

2024-08-16 19:55:50 3042

原创 有参转录组实战11-上传转录组到NCBI

传转录组的原始数据到NCBI

2024-05-11 12:01:33 1576

原创 有参转录组实战10-差异基因KEGG富集分析

KEGG富集

2024-05-10 22:28:21 472

原创 有参转录组实战9-差异基因GO富集分析

GO富集,对非模式物种制作ORG.DB包

2024-03-19 15:59:07 540 1

原创 有参转录组实战8-基因功能注释_GO_KEGG_swissprot_pfam_TFDB_iTAK

有参转录组实战8-基因功能注释_GO_KEGG_swissprot_pfam_TFDB_iTAK

2024-01-24 14:58:14 840

原创 有参转录组实战7-基因序列提取

传统的提取序列方式,有学习门槛,用TBtools也行。

2024-01-24 13:50:51 1645

原创 有参转录组实战6-差异基因绘制火山图

画个火山图

2024-01-08 18:45:55 567

原创 有参转录组实战5-差异基因分析

有参转录组实战5-差异基因分析

2024-01-07 21:52:18 651 1

原创 有参转录组实战4-可变剪接分析

可变剪接分析,有作用,但有显著作用的并不多

2024-01-06 22:53:15 722 1

原创 有参转录组实战3-计算readcount和TPM表达量

有参转录组实战3-计算readcount和TPM表达量

2023-11-30 17:32:26 565 1

原创 有参转录组实战2-将批量转录组比对到基因组上

有参转录组实战2-将批量转录组比对到基因组上

2023-11-28 13:50:15 501 1

原创 有参转录组实战1-批量质控-fastp

转录组进行实战分析,首先进行质量控制,使用fastp软件

2023-11-24 20:47:18 1202 1

原创 Linux系统命令,通配符与快捷键

以下为Linux系统的基础命令,部分通配符与快捷键,#后接英文标注注释

2023-07-15 17:29:20 113 2

原创 Linux系统中批量替换文件名

Linux系统中批量替换文件名

2023-07-05 14:36:48 514 2

原创 Linux系统上安装aspera并用其批量高速下载转录组数据

使用aspera能够帮助我们高速下载转录组等数据

2023-07-01 22:05:49 2229 8

原创 在linux系统上安装R语言

我们在linux系统里面安装R,能够分析许多大数据。

2023-07-01 20:59:30 2952 2

原创 使用Primer Premier 5软件设计引物

使用Primer Premier 5软件设计引物

2023-06-12 19:27:33 9049 3

原创 ImageJ软件测量叶片或其它样品面积

我们需要测量叶片或其它样品的面积时候,需要用到imageJ软件,拍照的时候记得加个标尺。

2023-06-12 14:49:12 2955 1

原创 Linux系统安装conda,镜像设置,环境变量

我们来看看在拥有服务器账号后,如何安装conda,conda是一个应用商店,可以通过这个软件来安装各种生信软件,并设置镜像和环境变量。

2023-04-23 12:46:21 3030 1

原创 Bioedit软件做测序后的序列比对和序列的反向互补与翻译

我有两段序列,一段是基因组提取出来的CDS序列,一段是PCR出来的测序的序列,我们需要将它们比对,看看有没有碱基的变化。这时候就需要用到Bioedit软件了。

2023-03-16 23:28:03 5240 1

原创 一文解决Windows系统上的R、Rtools、Rstudio的安装,镜像设置和BiocManager等R包的安装。

这个教程我做得非常好,不仅安装好了R,Rtools,Rstudio,还设置了镜像,示范安装R包,把许多散乱的教程都统一起来了,R语言初学者值得一看。

2022-12-10 21:39:36 6767 1

原创 Windows系统上安装java

有一些生信软件是java语言写的,就需要安装java才能运行,下面展示java的安装。

2022-12-10 21:29:42 2202 1

原创 基因家族的系统进化树-基于Windows系统上的iqtree

今天来讲如何构建系统进化树,使用的软件是iqtree,这是一个基于最大似然法估算的建树软件,可以在Windows系统上运行。

2022-12-10 21:22:03 2287 8

原创 基因家族的鉴定-基于Windows系统上的HMMER

基因家族的鉴定-基于Windows系统上的HMMER。

2022-12-10 21:15:43 2522 10

原创 基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast

基因家族的鉴定-基于windows系统上的本地blast

2022-12-10 21:07:55 1462 3

原创 TBtools的sequence toolkit常用功能介绍

TBtools的sequence toolkit常用功能介绍,可用于基因组的序列等信息提取

2022-12-10 21:02:16 2426 2

空空如也

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