单基因病精准解读:OMIM与ClinVar高效整合方案

以下为基于OMIM与ClinVar数据库整合的1350种单基因病快速解读技术方案的全面解析,涵盖数据库定义、整合方法、疾病分类标准及解读工具,引用资料以"[[序号]]"标注:


一、核心数据库的定义与功能

1. OMIM数据库:遗传病-基因关系的权威知识库
  • 定位:人类孟德尔遗传病与基因的综合性数据库,由约翰霍普金斯大学与NCBI维护,收录所有已知孟德尔遗传病及超15,000个人类基因信息。
  • 核心内容
    • 疾病表型:详细描述临床特征、诊断标准、治疗及致病机制,每个条目分配唯一6位MIM编号(如#100800代表囊性纤维化)。
    • 基因信息:染色体定位、基因结构、功能及动物模型数据,关联疾病表型。
    • 动态更新:每日更新,集成人类基因图谱(Gene Map)和疾病定位表(Morbid Map)。
  • 临床价值:提供基因-疾病关联的标准化参考,是遗传病报道必需标注的权威来源。
2. ClinVar数据库:变异临床意义的公共档案库
  • 定位:NCBI运营的开放数据库,聚焦遗传变异与疾病/药物反应的临床解读,整合dbSNP、OMIM等多源数据。
  • 核心机制
    • 变异分类:接受实验室提交的变异致病性评估(良性/致病/意义不明),通过RCV编号聚合共识(如RCV000000001)。
    • 证据整合
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