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原创 Anaconda 安装出现的conda无法使用问题
报错信息如下: Load Error: in C:\Users\username.condarc on line 4, column 0. Invalid YAML在知乎上看到一篇anaconda安利(安装)教程后,很受用,第一次安装anaconda时没有出现任何问题,但过了一段时间后,在cmd中输入conda,就出现上面的报错。在网络上没有找到合适的帮助信息,不知道到底哪里出了问题,重新安装
2017-05-13 14:04:22
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翻译 annovar对人类基因组和非人类基因组variants注释流程
部分翻译:Hui Y, Kai W. Genomic variant annotation and prioritization with ANNOVAR and wANNOVAR[J]. Nature Protocols, 2015, 10(10).此文只是用于作者和所有初接触annovar软件者分享交流。更深入学习请仔细阅读全文。转载请注明。ANNOVAR是一个perl编写的命令行工具
2016-04-27 16:38:17
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原创 perl中split分割字符串用法坑人的一些细节!!
好多天没有在这里记录啦。今天发现一个佷值得跟大家分享的小经验!如题!1、注意split,若以字符串最前面的一个字符作为分隔符的话,分割得到的数组的第一个是空白!!!!而不是后面的东西!这个坑了我好久好久!eg:>TRINITY_DN36413_c0_g1_i1_2,我要去掉“>”,试过用$_=~s/^>(TRINITY_DN\d+_c\d+g_\d+_i\d+)/$1/,但是匹配总是出问题
2016-04-14 21:07:09
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转载 Perl中"—>"箭头的意义及用法
看师兄的程序,里面用了很多箭头->。很长时间没有使用perl编程了,很多基本概念忘记了。在网上搜了很久,终于找到比较靠谱的答案。cited from http://write.blog.youkuaiyun.com/postedit flw的回答。有部分增改。-> 有两种用法,都和解引用有关。 第一种用法,就是解引用。 根据 -> 后面跟的符号的不同,解不同类型的引用,
2016-04-05 21:57:03
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原创 生物信息学菜鸟成长日记开通!
清明节假日归来~从今天起,每天晚上花上半个小时总结记录一下一的工作!一方面是督促自己,要每天做些实际的东西,真正沉下心来,心无旁骛,专注于科研工作;另一方面,记下自己的一些思考或者发现,或者从别处吸收到的一些好的东西。好记性终不如烂笔头,况且自己总觉得自己记性越来越差了。再者,自己从网友的各种分享中受益良多,总是一贯索取,绝不是我们中华民族的传统作风;另外,在搜找一些东西的时候,发
2016-04-04 22:28:32
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空空如也
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