文献解读|利用比较转录组和基因表达分析北极蓝藻耐盐机制

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该研究通过比较转录组和基因表达分析，揭示了北极蓝藻应对盐度变化的机制。在盐度降低时，Na+ -H+转运蛋白和Na+ -Pi转运蛋白表达增加，而盐度升高时，K+通道复合物过表达。此外，冰结合蛋白和抗冻蛋白的差异表达表明了低温适应与耐盐性的关联。这些发现有助于理解北极藻类在冰影响下的生存策略。

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TITLE：Salinity tolerance mechanisms of an Arctic Pelagophyte using comparative transcriptomic and gene expression analysis
译名：利用比较转录组和基因表达分析北极蓝藻耐盐机制
期刊：COMMUNICATIONS BIOLOGY
日期：2022年5月
下载链接：https://doi.org/10.1038/s42003-022-03461-2

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研究介绍：
在转录水平上，关于微生物对短期盐度变化的适应的研究极少。北极微藻受海冰融化的影响暴露于盐度较低的环境，冰冻期形成盐水通道，盐度又较高。本篇文章研究了一个与冰相关的微藻在盐度从45到8之间的转录反应。结果表明，当培养菌暴露于逐渐降低的盐度时，差异基因表达的反应是括号。与盐度变化相关的关键基因涉及特定的代谢途径、转录因子和调控因子、蛋白激酶、碳水化合物活性酶和无机离子转运蛋白。盐度降低时，浮游植物的Na±H+转运蛋白和Na+ -Pi转运蛋白过表达，盐度升高时，K+通道复合物过表达。几种抗冻蛋白，一种冰结合蛋白和一种参与冷适应的酰基酯酶的不同表达，被观察到对寒冷盐水北极条件的特定适应。

研究目的：
确定浮游植物（CCMP2097）对盐度变化的范围和响应，以更深入地了解与冰相关的北极藻类的潜在遗传能力，以适应其受冰影响的栖息地可能遇到的实际盐度范围。

材料与方法：
材料：
使用了来自加拿大魁北克省拉瓦尔大学环境与计量科学实验室（LARSEM）的0.22μm过滤人工海水。使用EcoSense™ EC300A电导率仪（YSI Inc.）测量盐度，并通过稀释进行调整，以获得45，35，25，16至8的盐度目标范围。