18、高效分类：槟榔 DNA 标记特征降维研究

高效分类：槟榔 DNA 标记特征降维研究

1. 槟榔棕榈数据库

本次研究考虑了六种槟榔棕榈地方品种，分别是来自哥斯达黎加的 Utilitis、巴拿马的 Tuira、哥伦比亚的 Putumayo、秘鲁的 Yurimagua、玻利维亚的 Tembé 和巴西的 Pará。品种选择标准由相关研究提出。每个类别有 13 个样本，每个样本有 89 个 RAPDS 标记。该数据库规模较小，且生化方法的实施成本很高，未来获得资金后有望扩大数据库。

DNA 是核苷酸的长聚合物，其骨架由通过酯键连接的糖和磷酸基团组成，每个糖连接着四种碱基分子之一，正是这四种碱基沿骨架的序列编码了信息。该代码通过将 DNA 链复制到相关核酸 RNA 中来读取。原始 DNA 分析是一种昂贵且耗时的技术，但它在遗传资源的决策、处理和保存、分类学以及系统分子研究等方面具有重要意义。为了减少描述范围，开发了多种技术，RAPDS 痕迹分析（随机扩增多态性 DNA）类似于指纹技术，它基于 PCR（聚合酶链式反应）来识别物种。本研究对每个个体的遗传物质进行分析，使用 89 个 OPC 引物（来自 Operon 公司），经过多次反应扩增后，获得具有清晰明确片段的信息变量，为每个槟榔棕榈得到一个包含 89 个二进制参数的向量，即标记和个体产生一个二进制矩阵，表明了六种不同槟榔地方品种中特定 RAPDS 引物的存在情况。

2. 特征降维

本研究使用了三种特征降维方法，分别是判别公共向量（DCV）、主成分分析（PCA）和独立成分分析（ICA）。
- 判别公共向量（DCV） ：作为参数化系统，DCV 技术用于提取每个类别的共同特征，消除每个类别中样本之间的差异。具体步骤