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GTDB-Tk-classify_wf结果输出文件完全解读
解析GTDB-Tk 的 classify_wf 工作流程输出的多个文件内容，包括对微生物基因组的比对、多序列对齐、分类和标记基因的分析结果。原创 2024-09-13 10:10:14 · 1762 阅读 · 0 评论 -
Linux中，批量重命名“.fna”文件为“.fa”文件
Linux中，批量重命名“.fna”文件为“.fa”文件——rename命令原创 2024-02-23 12:06:21 · 1252 阅读 · 1 评论 -
geNomad输出文件解读
geNomad：识别移动遗传元素——输出文件解读：6个目录文件、6个log原创 2024-02-22 15:56:30 · 2490 阅读 · 1 评论 -
Linux系统下，计算并输出宏组装数据N50/N90值
Linux系统下，计算并输出宏组装数据N50/N90值——bioawk原创 2024-02-19 12:57:04 · 2357 阅读 · 1 评论 -
Linux系统下，VIBRANT的安装及配置
ViIBRANT，一款开源的从宏组装数据中识别病毒contig的软件原创 2024-01-26 09:51:17 · 2838 阅读 · 1 评论 -
Linux系统下，病毒组分析模块化流程ViWrap的安装、配置与使用方法解读
Linux系统下，病毒组分析模块化流程ViWrap的安装与环境配置全流程解读，含conda activate报错解决方法原创 2024-01-19 14:26:55 · 2684 阅读 · 8 评论 -
宏转录组组装软件rnaSPAdes输出文件解读
rnaSPAdes作为宏转录组数据组装软件，数据结果表现优秀——共输出5个文件夹及14个单独的文件，transcripts.fasta是主要结果文件。原创 2024-01-18 11:07:25 · 1903 阅读 · 1 评论 -
宏基因组组装软件mataSPAdes输出文件解读
宏数据组装软件mataSPAdes输出文件解读——共7个文件夹和16个单独文件，scaffolds.fasta是最终组装结果原创 2024-01-16 10:24:27 · 3377 阅读 · 2 评论 -
linux系统下，将.fastq文件统一改为.fq文件
linux系统中将.fastq文件统一改为.fq文件——使用rename和mv循环原创 2024-01-15 09:47:37 · 1242 阅读 · 0 评论 -
linux系统下，fasta格式转为fastq
在生物信息学分析中常需要用到，将fasta格式的序列转为fastq，而后再压缩为fastq.gz格式上传。本篇记录如何将在linux系统中将fasta格式文件转为fastq.原创 2023-11-16 23:28:53 · 1295 阅读 · 2 评论