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原创 [ATOMSK建模]Stacking Fault

理想晶体在空间中的密排面具有特定的堆垛顺序，如FCC晶体{111}沿[111]方向的堆垛顺序为ABCABCABCABC......,而在实际晶体中，密排面顺序会遭到破坏与错排，可能会形成ISF(本征堆垛层错，Intrinsic Stacking Fault)，ESF(外禀堆垛层错，Extrinsic Stacking Fault)和Twin(孪晶)。运行完毕之后，会在当前文件夹创建三个新的文件夹，如图2所示，并将生成的模型对应保存在里面，且每个文件夹下对应41个结构文件。以下是脚本的具体内容。

2025-03-06 21:42:17 507

原创 [lammps案例]精确原子比高熵合金建模

在lammps中建立高熵合金模型是通过替换原子的方式实现的，其命令为set type/ratio, 其缺点为多次替换之后，各原子之间的比例将不准确。在此通过变脚本书写方式，建立准确原子比例的高熵合金。本文以FeNiCrCoCu高熵合金为例，如图1所示，其晶体结构为FCC，原子比例Fe:Ni:Cr:Co:Cu=25:15:20:25:15。

2025-03-06 21:40:14 294

原创 [lammps后处理]温度云图的绘制

好看的云图对我们论文的质量有着至关重要的影响，lammps中如下图lammps仿真过程通过输出温度数据、用origin绘制的的温度分布云图：

2022-09-21 11:06:24 7564

原创【无标题】

在进行分子动力学模拟的过程中，结果的处理往往比模拟过程还难，如何做出让人眼前一亮的结果图。有些方向需要输出原子的位移云图和位移矢量图，原子位移可以反映模型的变形程度。如下图的位移云图和矢量图。图参考自：Hao Li, Tianyu Yan, Kristen A. Dynamic Contact Angles and Mechanisms of Motion of Water Droplets Moving on Nanopillared Superhydrophobic Sur...

2022-05-25 10:21:26 3204

原创 [lammps教程]OVITO绘制原子运动轨迹线

一区Script Materialia期刊：多主元素合金中的短程有序域扩散一文，研究了CrCoNi合金和MoNbTa合金中原子的扩散过程，文中有出现如下图所示的原子运动轨迹线。这种原子运动轨迹线我们在研究扩散过程中常常会用到。图参考自：Bin Xing, Xinyi Wang, William J. Short-range order localizing diffusion in multi-principal element alloys，Scripta Materialia, 20..

2022-05-25 10:19:22 8023 6

原创 [lammps教程]OVITO输出RDF

近期，许多小伙伴咨询小编如何进行径向分布函数分析，如湖南大学材料科学与工程学院刘海蓉老师课题组发表在物理学报的一文：《冷速对液态金属Mg凝固过程中微观结构演变的影响》中，通过对金属Mg在不同温度下的径向分布函数（RDF）分析，表征液态金属Mg凝固过程的结构演变，如下图文中的液态金属 Mg 在不同冷却速度下凝固的双体分布函数 g(r) 曲线：图参考自：吴博强，刘海蓉，刘让苏. 冷速对液态金属Mg凝固过程中微观结构演变的影响. 物理学报，2017.小编之前出过一期利用命令输出RDF数据的教...

2022-05-25 10:16:38 11699

原创 [lammps安装教程]lammps并行版安装教程

大家好，最近有好多小伙伴咨询小编lammps的安装教程，本期小编就再讲解一期lammps并行版的安装教程，让各位久等了。lammps串行版：调用电脑单核运行，安装及运行命令简单，但运算速率较慢。lammps并行版：调用电脑多核运行，安装复杂但运算速率较快。01下载安装包lammps安装包在lammps官网下载。官方下载连接： https://packages.lammps.org/windows.html1.打开链接后的界面如下： ...

2022-04-10 11:40:42 21200 9

原创 [lammps安装教程]lammps串行版安装教程

大家好，最近有好多小伙伴咨询小编lammps的安装教程，本期小编就先讲解一期lammps串行版的安装教程，下一期将出lammps并行版的安装教程。lammps串行版：调用电脑单核运行，安装及运行命令简单，但运算速率较慢。lammps并行版：调用电脑多核运行，安装复杂但运算速率较快。01下载安装包lammps安装包在lammps官网下载。官方下载连接： https://packages.lammps.org/windows.html1.打开链接后的界...

2022-04-10 11:38:05 3654

原创 [lammps教程]lammps原子沉积实例教程

原子层沉积是一种可以将物质以单原子膜形式一层一层的镀在基底表面的方法。原子层沉积与普通的化学沉积有相似之处。但在原子层沉积过程中，新一层原子膜的化学反应是直接与之前一层相关联的，这种方式使每次反应只沉积一层原子。本文小编将介绍原子在加热的原子衬底上的沉积。如下图为本文模拟的原子沉积过程01使用命令使用fix langevin命令语法：fix ID group-ID langevin Tstart Tstop damp seed keywo...

2022-04-10 11:35:39 5421 1

原创 [分子动力学模拟资料]几种常用力场参数网站及LJ参数计算

原创一直陪着你的LAMMPS交流站我们在使用分子动力学模拟时，常常需要力场参数或势函数文件，本文就推荐几个常用的EAM势＼MEAM势及LJ势的力场参数网站，欢迎大家补充。力场参数常用网站EAM势及MEAM势:1.lammps官网:https://www.lammps.org/lammps官网的GitHub是时常更新的,比我们安装目录下的势文件要多,在这里可能会找到我们需要的势文件2.Interatomic Potentials Reposit...

2022-04-10 11:31:12 19865 1

原创 [lammps教程]OVITO绘制原子应力云图

在我们用分子动力学模拟力学性能时，应力应变云图是我们模拟结果中常常出现的，如下图为分子动力学的铜铅合金拉伸变形特性的研究一文中铜铅合金剪应力云图，本文介绍如何利用OVITO软件绘制原子应力云图。图参考自：韩浏淼. 基于分子动力学的铜铅合金拉伸变形特性的研究[D].哈尔滨工业大学,2018.具体步骤1.导入dump文件在OVITO软件中导入我们的结果dump文件。2.Add modification--Atomic strain3.Add m...

2022-04-10 11:27:15 15948 3

原创 [lammps命令]thermo_style 命令详解（1）

大家好，最近小编经常在后台看见小伙伴们的留言，有好多小伙伴对thermo_style命令还不是很熟悉，本期小编就具体讲解一下lammps中的thermo_style命令，当然，具体大家也可以在lammps官网查看手册。01官网介绍1.thermo_style命令介绍 thermo_style命令在我们模拟过程中，可实时将我们模拟的一些参数显示到lammps运行窗口中,也可运行后的log文件中查看,如下图所示：2.thermo_style命令语法the...

2022-04-10 11:24:36 5930

原创 lammps统计原子个数

[lammps第十七讲]lammps统计原子个数原创一直陪着你的LAMMPS交流站2021-11-18 18:00收录于话题#lammps21个内容#lammps后处理17个内容大家好，之前一直有小伙伴想让小编出一期统计原子数量的教程，鉴于小编最近科研任务缠身，最近抽出一点时间来满足下小伙伴的愿望。不足之处请各位指出，希望能给读者提供一定的帮助，同时希望专业前辈提出不足，小编会和大家共同学习。01官网用法小编也是向老师请教...

2021-11-30 22:10:26 6250

原创 lammps多孔结构

原创公众号LAMMPS交流站点击上方蓝字关注我们大家好，我是YJ学长，本文的模型是小编在lammps模拟Ni的熔化过程中偶然生成了一帧多孔结构，小编觉得图挺好看的，因此做一期推送共同来讨论这一现象。因能力有限，这种偶然生成的结构欢迎专业前辈能提出建议。首先是本文建立的Ni金属团簇模型。 01完整代码完整in文件如下：# Ni:1能量最小化、2弛豫、#------------------start...

2021-11-30 22:02:44 1531

原创 lammps高熵合金熔炼过程分子动力学模拟

原创公众号LAMMPS交流站javascript:void(0); 大家好，前面小编讲解了一期层合结构的建模，小编本期基于之前的层合结构，设置5种金属建立高熵合金模型，进行一个高熵合金熔炼过程的分子动力学模拟。不足之处请各位指出，希望能给读者提供一定的帮助，同时希望专业前辈提出不足，小编会和大家共同学习。01基本思路1.建立初始构型2.能量最小化3.保温固熔及保温固凝02完整代码完整in文件如下...

2021-11-30 21:56:48 3124

原创 lammps输出MSD（均方根位移）详解及示例教程

[lammps第十五讲]lammps输出MSD（均方根位移）详解及示例教程原创一直陪着你的LAMMPS交流站2021-10-23 11:45收录于话题#lammps21个内容#lammps后处理17个内容大家好，前面小编讲解了一期RDF（径向分布函数）的详解及LAMMPS输出过程，就有很多小伙伴问到小编MSD的LAMMPS输出过程，所以本期小编本期介绍下MSD（均方根位移）的输出办法，小编就把自己学到的在这里跟大家分享，也算是小编学习过程中的一个笔记。本教程也是...

2021-11-30 21:50:07 21854 6

原创 lammps输出RDF（径向分布函数）详解及示例教程

[lammps第十四讲]lammps输出RDF（径向分布函数）详解及示例教程原创一直陪着你的LAMMPS交流站2021-10-18 11:40收录于话题#lammps案例16个内容大家好，小编最近的课题需要输出RDF（径向分布函数），小编就去lammps官网及网络查找了如何用lammps输出RDF，小编就把自己学到的用法在这里跟大家分享，也算是小编学习过程中的一个笔记。本教程也是小编现学现卖，不足之处请各位指出，希望能给读者提供一定的帮助，读者可结合实际需求，同时希望专业前辈...

2021-11-30 21:45:50 29315 2

原创 lammps编织结构建模

公众号LAMMPS交流站编织结构一般指织物的几何结构，是经纱和纬纱在织物中相互之间的空间关系。织物结构对织物的机械物理性能有很大的影响，而且会影响织物的外观效应。机织物、针织物、无纺织布等几大类织物各有不同的结构特点。交叉和绕结是纱线能构成的两种稳定结构关系。使织物保持稳定的形态和特定力学性能。织物中的纱线有各自的运行方向、运行规律，形成了不同的组织结构。早就有文献已经出现了编织结构的分子模型，文献很多。本期介绍一种编织结构的lammps建立过程，用到的软件仅有Lammps。如下图为常见的编织结构简图

2021-11-30 21:40:27 772

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