viola_的博客

解决sudo 时赋予当前账户root权限（可以修改系统文件），gedit是一个编辑器，可以换成别的编辑器，如gvimsudo gedit ~/.bashrc第二步：添加到最后即可export PATH=$PATH:/root/anaconda3/bin/condaexport PATH=$PATH:/usr/bin/yum第三步：更新.bashrc文件source ~/.bashrc...

[bwa_aln_core] convert to sequence coordinate... 0.41 sec[bwa_aln_core] refine gapped alignments... 0.07 sec[bwa_aln_core] print alignments... 0.09 sec[bwa_aln_core] 33353877 sequences have been processed.[main] Version: 0.7.17-r1188[main] CMD: bwa sa

下载python2.7版本wget https://www.python.org/ftp/python/2.7.18/Python-2.7.18.tgz解压tgz包tar -zxvf Python-2.7.18.tgz把python移到/usr/local下面mv Python-2.7.18.tgz /usr/local删除旧版本的python依赖ll /usr/bin | grep pythonrm -rf /usr/bin/python进入python目录cd /usr/l.

报错 File "/bin/yum", line 30 except KeyboardInterrupt, e: ^ SyntaxError: invalid syntax解决：linux安装python2.71、下载pythonwget https://www.python.org/ftp/python/2.7.16/Python-2.7.16.tgz2、解压、编译安装（依次执行以下5条命令）#tar -zxvf Pytho

1、报错：找不到命令[root@node01 fengyongxian]# vim /etc/profile[root@node01 fengyongxian]# which python/usr/local/bin/python[root@node01 fengyongxian]# vim /etc/profile[root@node01 fengyongxian]# macs2bash: /home/fengyongxian/shm/tartar/miniconda/yes/bin/mac

[main] Version: 0.7.17-r1188[main] CMD: bwa samse hg19.fa OUTdir12/index-1_1.valid.fastq.sai OUTdir12/index-1_1.valid.fastq[main] Real time: 397.832 sec; CPU: 379.342 secbwa_wrap hg19.fa OUTdir12/index-1_2.valid.fastq 1 OUTdir12/index-1_2.valid.sam 1Ru

1、什么是ChIA-PET2？能够分析不同类型的ChIA-PET数据从原始的测序读段，形成染色质互作环（chromatin loops）的有效便捷的工具ChIA-PET2整合了ChIA-PET数据分析的所有步骤，包括linker trimming，read alignment，duplicate removal，peak calling和chromatin loop calling2、流程3、命令ChIA-PET2 -g genomeindex -b bedtoolsgenome -f fq1

1、安装zlibsudo apt install zlib1g-dev2、安装bedtoolssudo apt-get install bedtools

1、 apt 安装方法(最好用)ubuntu 默认的软件管理系统是apt。apt-get 的基本软件安装命令是:sudo apt-get install <package_name>2、 yum 安装方法yum 是一个在 Fedora 和 RedHat 以及 SUSE 中的 Shell 前端软件包管理器。也可以安装在 ubuntu 上。yum install <package_name>3、tar.gz 软件包的安装（每个步骤都有报错的可能）1）解压tar.gz包

1、点虚拟机-安装VMware Tools2、下载完成后将压缩包放到home路径下，我放到了下载3、在此路径下打开终端，开始解压复制下来压缩包名字tar -zxvf VMwareTools-10.3.22-15902021.tar.gzsudo ./vmware-install.pl4、执行时，有【yes】，就输入yes这个过程中有很多的yes和回车，直到看到enjoy提示【enjoy】，表示已完成。5、安装完成后运行下面的命令重新启动虚拟机：sudo reboot就可以使

1. 打开“软件和更新”设备2、选择 Ubuntu软件中源代码选中国镜像源，我选的aliyun3、建议新手不要用代码改镜像源原因：> https://www.jianshu.com/p/432b4698e30a

一、用命令更新与升级sudo apt-get updatesudo apt-get upgrade二、命令中涉及的知识：1、sudo：允许系统管理员让普通用户执行一些或者全部的root命令的一个工具2、apt-get：对于安装、卸载、升级软件提供一条龙服务，比源码安装更方便①源码安装：有出现莫名其妙问题的隐患./configuremakemake install ②apt-get指令安装：更方便sudo apt-get install XXXsudo apt-get