比较基因组学研究进展与基因组等分问题解析
1. 比较基因组学会议概况
比较基因组学领域发展迅速,相关研究不断涌现新的算法、统计和数学技术。RECOMB卫星研讨会——比较基因组学国际研讨会(RECOMB - CG)为该领域的科学家提供了交流平台。2010年10月9 - 11日在加拿大渥太华举办的RECOMB - CG 2010会议,收到了35份投稿,经过至少2名(平均2.9名)程序委员会成员评审,最终接受了24篇论文。会议还安排了6场邀请报告,演讲者来自多伦多大学、康奈尔大学等知名高校。
会议的组织架构完善,设有会议主席、指导委员会、本地组织委员会、程序委员会主席和程序委员会等。以下是部分重要委员会成员信息:
|委员会名称|成员|
| ---- | ---- |
|会议主席|David Sankoff(加拿大渥太华大学)|
|指导委员会|Aoife McLysaght(爱尔兰都柏林圣三一学院)、Jens Lagergren(瑞典皇家理工学院)、David Sankoff(加拿大渥太华大学)|
|程序委员会主席|Eric Tannier(法国里昂大学INRIA)|
该会议此前还在多个城市举办过,如2003年在美国明尼阿波利斯、2004年在意大利贝尔蒂诺罗等。
2. 基因组等分问题背景
比较含有重复基因的两个基因组是一项具有挑战性的任务,目前用于比较基因组的距离指标(如断点距离、反转距离、双切接距离等)都难以处理重复基因。但在所有基因重复相同次数的特殊情况下,已有一些研究取得了进展。
基因组等分问题旨在给定一个每个基因恰好有p个拷贝的基因组,找到一个每个基因只有一个拷贝的基因组
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