Linux下手动编译安装R包（今日份收获）

不管是在windows下还是Linux下，我们安装R包的方法最常用最无脑的方法，自然是install.packages("package_name")，但是很多情况下并不能如愿：

本人今天安装ASMap包时也失败了，于是在各种折腾之下学会了手动安装R包。

第一步需要用wget下载R包到服务器，或者使用浏览器下载到windows下，再上传到服务器。PS.下载到服务器上的R包还需要解压缩

第二步需要找到自己在服务器上安装的R包的library库的绝对路径。

先进入R交互式命令行，然后使用命令install.packages("package_name",repos = NULL)，这样可以找到library路径。

第三步在bash命令行下编译安装R包。

R CMD INSTALL -l /path/to/your/library  /path/to/your/downloaded/package

这样就完成R包的手动安装了。目前我个人觉得这种安装方法是万能的，但是有一个最大的缺陷的，一旦你要安装的R包存在依赖包，那么还需要先安装依赖包，才能安装需要的R包。

 

另，推荐一下Bioconductor安装R包，基本很多用的上的R包都可以使用这种方法安装：

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

biocLite("package_name")