Linux“terminate called after throwing an instance of std::bad_alloc what(): std::bad_alloc Aborted ”

      最近在Linux下使用bedtools软件，在使用bedtools coverage时一直出现如下报错：

terminate called after throwing an instance of 'std::bad_alloc'
what(): std::bad_alloc
Aborted (core dumped)

      在网上查阅了很多，所有人都说是内存不够，但是并没有给出合适的解决办法。

      既然是内存不足，我第一反应是在PBS上一个人霸占一个结点的全部cpu，这样就可以使自己一个人使用全部的内存，但是却仍然报错。于是使用bedtools coverage -h仔细看了一下：

发现当输入的bam文件是经过sort的话，可以加上-sort参数，而几乎所有我们会用到的bam文件都是经过sort的，我的也不例外，于是我尝试了一下加上-sorted，意外的发现解决了这个问题，不再出现内存不足的报错。