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原创 targetscan 自定义小RNA序列

targetscan仅支持预测miRNA的靶基因,但是其它小RNA无法预测。所以我们要从targetscan下载perl工具后,在本地进行预测。解压缩后如图::Tab 分隔的三列文件(Tfr-102960610090安装MSI文件,这个文件可以自动配置环境,比较省心省力。

2025-03-01 09:21:19 392

原创 conda环境下的R包estimateCellCounts2处理甲基化数据[preprocessQuantile] Quantile normalizing报错,一句代码解决。

找了很多解决方案,这个是最简单实用的!退出R后直接输入以下代码即可解决。

2024-11-07 16:30:45 115

原创 linux安装使用GCTA

文件:gcta_1.94.0beta.zip。三、 更改至解压缩路径。

2024-08-20 16:16:09 408

原创 linux 安装R包的方法汇总

网络搜索ggplot2,找到以tar.gz结尾的链接,复制。目前就找到以上几种,还有什么好用的方法欢迎补充。选择其中一个安装代码,粘贴到conda即可。2.5 使用BiocManager安装。随便点击一个以r-包名字结尾的链接。1.2 直接在conda环境中安装。2.2 直接找到包的安装链接安装。找到R包所在的库,复制地址后安装。2.3 下载包到本地进行安装。在搜索框中搜索需要安装的R包。2.4 从Github上安装。一、在conda环境下安装。1.1 使用官网安装链接。2.1 使用安装代码安装。

2024-06-13 12:20:17 988

原创 linux conda环境中安装最新的R

七、将安装R的绝对路径添加到.bashrc中的。三、添加一些conda channel。十一、 安装BiocManager。一、创建环境,命名为R44。退出并保存修改之后的文件。二、激活conda环境。重新进入R,并查看镜像。五、安装需要的安装包。更新 .bashrc。

2024-06-09 14:08:52 1698 2

原创 linux 显示更改当前目录,查看文件夹权限

d”代表目录, r代表可读权限,w代表可写权限,x代表可执行权限。2-4位代表所有者user的权限说明,5-7位代表组群group的权限说明,8-10位代表其他人other的权限说明。cd后面是需要更改的路径。一、显示目前工作路径。

2024-06-09 11:17:33 293

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