MPI 并行计算中的数据分发、聚集与并行示例
在并行计算领域,MPI(Message Passing Interface)是实现分布式内存并行的核心工具。下面将深入探讨 MPI 中的数据分发与聚集操作,以及数据并行策略的具体示例。
1. MPI 数据分发与聚集
在 MPI 中,数据的分发(distribute)和聚集(gather)是常见操作。进行这些操作时,所有进程的数据大小和偏移量必须已知。以典型代码为例,在数据分发中,使用 MPI_Scatterv 函数,其参数包括数据源的缓冲区(buffer)、各进程的数据数量(counts)、偏移量(offsets)和数据类型,目标进程则通过标准三元组处理,发送数据的源进程指定为秩 0(rank 0),最后一个参数是通信组(comm),即接收数据的进程组。
而 MPI_Gatherv 则执行相反的操作,将各进程的数据聚集到指定进程。在使用 MPI_Gatherv 时,需注意其使用的大小和偏移量均为整数类型,这限制了可处理的数据大小。曾有人尝试在 MPI 标准 3 版本中将数据类型改为长整型以处理更大数据,但因会破坏许多应用程序而未获批准,期待未来 MPI 标准能添加支持长整型的新调用。
2. 数据并行示例
数据并行策略是并行应用中最常见的方法,下面通过几个具体例子来详细说明。
2.1 流三元组(Stream Triad)测试节点带宽
流三元组是一种带宽测试基准代码,使用 MPI 可让更多进程在节点甚至多个节点上工作,目的是测试所有处理器都使用时节点的最大带宽,为
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