医疗保健语义模型的评估与可视化
1. 可视化现状与需求
目前,许多可视化技术的实现特性仍是一个问题,在未来几年内,很难想象会有合适的工具出现。这里将“可视化”理解为以图形方式编辑本体的机会,这一选择不仅在一般情况下是正确的,在医疗保健相关领域更是如此。对于那些可能没有深入 IT 知识,无法用 SPARQL 等语言对数据模式构建查询的医疗领域专家来说,这种可视化编辑方式尤为有用。尽管 SPARQL 直观且与经典 SQL 相似,但开发更复杂的查询时,仍会给医疗人员带来巨大挑战。
虽然领域特定本体越来越细化,如生物样本库或表型相关本体,但可视化却趋于通用化。目前存在对通用本体可视化框架的需求和供应,该框架需实现一组核心的视觉和交互功能,并可根据用例进行扩展和定制。然而,现有的可视化框架无法满足语义网社区的当前需求,没有标准且推荐使用的可视化框架,选择仍掌握在用户手中。这就需要为用户提供选择指南,因为不同任务和用例可能需要不同的本体可视化方法,而且该领域新方法和工具常从头开发。
可视化现有本体有助于决定是否复用它来注释新数据,通过检查本体的类和属性是否适合新需求。这在医疗保健领域尤为有益,不同研究组、机构甚至国家可借此评估并交流经验,确保数据的一致性。例如,不同国家的生物样本库使用同一本体时,可通过这种方式实现数据的高度集成。
2. 评估的必要性
部署的语义模型通常用于大型复杂系统,人们会直观认为开发者已准确完善地开发了语义模型的每个建模语言工件。但实践表明,开发者常参考现有类似工件并整合最佳实践,以使用户更易使用。例如在建模语言中,常参考 UML 和 BPMN 规范。然而,从外部不同导向的解决方案派生组件,可能会对所提解决方案的特性产生负面影
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