生物预测与情感交互模型的研究进展
1. O - 糖基化预测研究
1.1 不同编码方式下的预测指标
在O - 糖基化预测的研究中,采用了多种编码方式进行实验,包括稀疏编码(Sparse)、5 - 字母编码(5 - letter)和多重编码(Multiple)。实验分别在不同的窗口大小(Ws)和多重编码的窗口大小(Wc)下进行,评估了准确性(Ac)、敏感性(Sn)和特异性(Sp)三个指标,具体数据如下表所示:
|编码方式及参数|信息类型|Ac|Sn|Sp|
| ---- | ---- | ---- | ---- | ---- |
|Sparse, Ws = 5|序列信息|0.733|0.600|0.800|
|Sparse, Ws = 5|二级结构|0.759|0.522|0.877|
|Sparse, Ws = 5|可及性|0.755|0.522|0.872|
|Sparse, Ws = 7|序列信息|0.755|0.533|0.866|
|Sparse, Ws = 7|二级结构|0.759|0.477|0.900|
|Sparse, Ws = 7|可及性|0.751|0.622|0.816|
|Sparse, Ws = 21|序列信息|0.696|0.555|0.767|
|Sparse, Ws = 21|二级结构|0.707|0.644|0.739|
|Sparse, Ws = 21|可及性|0.688|0.644|0.711|
|5 - letter, Ws = 9|序列信息|0.663|0.289|0.850|
|5 - letter, Ws = 9|二级结构|
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