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Longyan_sysu
这个作者很懒，什么都没留下…
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中山大学南方一号集群系统安装和使用Samtools
作者：龙炎联系邮箱：1125570247@qq.com时间：2016/08/11 安装说明第一步，下载samtools-1.3.1.tar.bz2$wgethttps://sourceforge.net/projects/samtools/files/samtools/1.3.1/第二步，解压$tar –jxvf samtools-1.3.1.tar.bz2第三原创 2016-08-11 17:08:29 · 1694 阅读 · 0 评论 -
中山大学南方一号集群系统安装和使用NextGenMap
作者：龙炎联系邮箱：1125570247@qq.com时间：2016/08/11 安装环境：GCC –v 4.4.6安装说明第一步，下载NextGenMap-0.5.0.tar.gz$wget https://github.com/Cibiv/NextGenMap/archive/0.5.0.tar.gz第二步，解压$tar –zxvf NextGenMap-0原创 2016-08-11 17:10:41 · 1069 阅读 · 0 评论 -
中山大学南方一号集群系统安装ABySS 1.9.0
作者：龙炎联系邮箱：1125570247@qq.com时间：2016/07/25 安装环境：GCC –v 4.8.2Openmpi –v 1.4.3ABySS依赖的库有：Boost, OpenMPI, sparsehash, SQLite安装AbySS之前要先安装boost, sparsehash, sqlite，下面安装示例均安装在$HOME目录下，建议安装到自己创建原创 2016-08-11 17:14:04 · 1558 阅读 · 0 评论 -
ABySS使用文档
作者：龙炎联系邮箱：1125570247@qq.com时间：2016/07/25 一．ABySS的功能分别为： 组装paired-end库(paired-endlibrary)，组装多个库(multiplelibraries)， 组装长距离的mate-pair库(Long-distance mate-pair libraries)，Resc原创 2016-08-11 17:16:07 · 3848 阅读 · 0 评论 -
Converts Blast database format in FASTA format
实例，将16SMicrobial数据库转为一个reference.fa文件第一步，进入数据库目录$cd 16SMicrobial第二步，用blastdbcmd进行转换$blastdbcmd –entry all –db 16SMcrobial –out reference.fa原创 2016-08-11 17:19:36 · 598 阅读 · 0 评论 -
linux安装ABySS
安装环境：Ubuntu 14.04 gcc version 4.8.41. 安装openmpiLinux 下输入命令(1)获取openmpi包：wget http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.4/downloads/openmpi-1.4.3.tar.bz2(2)解压：tar jxvf openmpi-1.4.3原创 2016-07-14 11:59:05 · 3308 阅读 · 0 评论