本文档详细介绍了在没有root权限的Ubuntu 14.04环境中，如何一步步手动安装ABySS。首先，安装openmpi，包括获取包、解压、配置、编译和安装。然后，安装Google sparsehash，同样经过下载、解压、配置、编译和安装步骤。接着，安装sqlite3，通过下载、解压、配置、编译和安装完成。最后，安装ABySS，配置时特别设置了最大k-mer值、MPI支持和sqlite3路径，并更新环境变量确保ABySS能被正确调用。
安装环境：Ubuntu 14.04
gcc version 4.8.4
1. 安装openmpi
Linux 下输入命令
(1)获取openmpi包：
wget http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.4/downloads/openmpi-1.4.3.tar.bz2
(2)解压：
tar jxvf openmpi-1.4.3.tar.bz2
(3)进入解压后的文件夹：
cd openmpi-1.4.3/
(4)配置，在配置的时候将安装目录统一指定为$HOME，将程序执行文件，库文件及头文件全部安装在自己的目录下，因为没有root权限， --enable-mpi-threads表示允许多进程运算。
./configure --prefix=$HOME --enable-mpi-threads
配置时发现少了Boost C++ Libraries，该库文档的链接为：
http://www.boost.org/doc/libs/
输入命令：（如果原本有的这个Boost C++库的话这步可以忽略），这里要用到管理员权限：
sudo apt-get installbuild-es
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