生物信息学中的关键任务解析
1. 生物数据处理的重要性
蛋白质在多细胞生物体内扮演着多种关键角色。以皮肤、毛发、老茧、软骨、肌肉、肌腱和韧带等形式存在时,蛋白质将生物体的身体各部分连接在一起,起到保护作用并赋予其结构;以酶、激素、抗体和球蛋白等形式存在时,它们催化、调节和保护生物体的化学反应;以血红蛋白、肌红蛋白和各种脂蛋白等形式存在时,它们实现了氧气和其他物质在生物体内的运输。而生物信息学则致力于解决一系列与生物数据相关的重要问题。
2. 生物信息学的主要任务
2.1 序列比对与比较
序列比对是将两个或多个序列进行相互排列,以展示它们的相似和不同之处。主要包括DNA、RNA、蛋白质序列的比对和预测,以及DNA片段的组装。常见的比对方法有全局比对和局部比对:
- 全局比对 :最大化序列全长上的匹配数量,适用于已知非常相似的序列。
- 局部比对 :为两个序列的局部匹配提供最高得分,用于寻找序列中局部高度相似的区域。
动态规划算法(如Smith–Waterman算法)可实现生物序列的高效完整比较,通过插入空格(间隙)来实现序列的对齐,并生成相似性得分。常见的比对技术有BLAST、FASTA和PSI - BLAST等。多序列比对则将一组序列排列,使同源序列位于同一列。
2.2 基因和功能位点的识别
- 基因寻找 :主要是识别具有生物学功能的序列片段,如蛋白质编码基因、非编码RNA基因和调控区域等。在人类基因组中,蛋白质编码区域仅占一小部分,因此在大片未表