IGV-Introduction

最新推荐文章于 2024-05-23 09:48:17 发布
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Basic IGV Introduction Banner Wang C November 11th, 2021

Learning Objectives

  • Basic IGV windows Introduction
  • Visualization of data

Official website

https://github.com/griffithlab/rnaseq_tutorial/wiki/IGV-Tutorial

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1 The tool bar provides access to commonly used functions. The menu bar and
最低0.47元/天 解锁文章
igv-reports:Python应用程序生成独立的igv.js页面，可以使用“文件”协议在浏览器中打开该页面
05-07
igv-reports需要Python 3.6或更高版本以及pip 。 与所有Python项目一样，建议使用虚拟环境。 遵循有关使用conda创建虚拟环境的说明。 1.从安装Anaconda 2.创建一个虚拟环境 conda create -n myenv python=3.7.1 ...
IGV-windows-2.10.0-with-jave-个人学习
01-03
仅限个人学习用，禁止商业用途！
如何对基因组序列进行注释
weixin_33770878的博客
09-06 9413
基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction)：通过已有的概率模型来预测基因结构，在预测剪切位点和UTR区准确性较低 同源预测(homology-based prediction...
易基因｜ChIP-seq分析方法：实用的工作流程和高级应用
E_gene的博客
07-19 4517
2020年03月，《Methods》杂志上发表一篇关于表观组学ChIP-seq分析方法的综述文章，详细介绍了染色质免疫共沉淀（ChIP-seq）的工作流程和高级应用。以下为原文总结分享：一、介绍（Introduction）染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）是表观基因组学研究中的一种主要方法。全基因组的组蛋白修饰分析（如增强子分析和全基因组染色质状态注释）可以系统分析表观基因组如何促进细胞身份(cell identity)、细胞发育、细胞谱系规...
图文详解 VCF 生信格式 (变异信息)
Baimoc
11-09 8444
vcf （Variant Call Format）是一种用于存储基因组序列中的变异信息一般用在 单核苷酸变异（SNV），小片段插入缺失（INDEL）等也用于 拷贝数变异（CNV），SV（结构变异）等SNV：参考基因组在1号染色体7845190为 C，但检测样本在同样位置为 AINDEL：包含插入和缺失两种。
RNA-seq: differential gene expression analysis
chenzeyu110的博客
11-21 3795
http://monashbioinformaticsplatform.github.io/RNAseq-DE-analysis-with-R/99-RNAseq_DE_analysis_with_R.html Monash Bioinformatics Platform RNA-seq: differential gene expression ana
GNSS 精密星历 (轨道钟差) 产品内容解读
一些笔记
04-17 4228
精密轨道钟差产品是 GNSS 精密单点定位 PPP 的先决条件，如果想要编程实现 PPP 的话，有必要对其文件组织方式进行详尽的了解。本文以官网格式说明为蓝本，结合笔者的经验和一个示例，详细地介绍了精密轨道钟差产品的文件内容和格式组织形式。
cassandra cql
fyifei0558的专栏
11-29 2676
Cassandra Query Language (CQL) v3.4.2 Cassandra Query Language (CQL) v3.4.2 CQL Syntax PreambleConventionsIdentifiers and keywordsConstantsCommentsStatementsPrepared Statement Data Definit
JIT编译器
weixin_30666401的博客
11-21 99
深入理解Java Class文件格式（九） http://blog.youkuaiyun.com/zhangjg_blog/article/details/22432599 http://blog.youkuaiyun.com/zhangjg_blog/article/details/22205831 Introduction to Compiler Construction in a Java World ht...
346个基因组可视化工具一网打进！
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悟道西方
11-04 1万+
Github来源：https://github.com/cmdcolin/awesome-genome-visualization配套网页：https://cmdcolin.github....
Python库 | igv-0.1.1.tar.gz
03-06
《Python库igv-0.1.1：深入解析与应用》 在Python的世界里，丰富的库资源是其强大功能的重要支撑。今天我们要探讨的是一个名为"igv"的库，版本为0.1.1，它以".tar.gz"的压缩格式提供，这表明它是遵循Unix/Linux系统...
【亲测免费】 探秘RSEM：精准RNA测序表达量分析的利器
gitblog_00036的博客
05-23 1687
[RSEM](#introduction)（RNA-Seq by Expectation-Maximization）是由哈佛医学院Bo Li博士开发的一款强大的软件工具，专用于从RNA测序数据中估算基因和转录本的表达水平。RSEM提供了一个用户友好的界面，并支持多线程计算，适用于单端和双端读取数据，包含质量分数、可变长度读取以及RSPD估计。此外，它还提供了后验均值和95%可信区间估计，便于数据可...
基于数据驱动的 Koopman 算子的递归神经网络模型线性化，用于纳米定位系统的预测控制研究（Matlab代码实现）
11-27
基于数据驱动的 Koopman 算子的递归神经网络模型线性化，用于纳米定位系统的预测控制研究（Matlab代码实现）内容概要：本文围绕“基于数据驱动的Koopman算子的递归神经网络模型线性化”展开，旨在研究纳米定位系统的预测控制问题，并提供完整的Matlab代码实现。文章结合数据驱动方法与Koopman算子理论，利用递归神经网络（RNN）对非线性系统进行建模与线性化处理，从而提升纳米级定位系统的精度与动态响应性能。该方法通过提取系统隐含动态特征，构建近似线性模型，便于后续模型预测控制（MPC）的设计与优化，适用于高精度自动化控制场景。文中还展示了相关实验验证与仿真结果，证明了该方法的有效性和先进性。; 适合人群：具备一定控制理论基础和Matlab编程能力，从事精密控制、智能制造、自动化或相关领域研究的研究生、科研人员及工程技术人员。; 使用场景及目标：①应用于纳米级精密定位系统（如原子力显微镜、半导体制造设备）中的高性能控制设计；②为非线性系统建模与线性化提供一种结合深度学习与现代控制理论的新思路；③帮助读者掌握Koopman算子、RNN建模与模型预测控制的综合应用。; 阅读建议：建议读者结合提供的Matlab代码逐段理解算法实现流程，重点关注数据预处理、RNN结构设计、Koopman观测矩阵构建及MPC控制器集成等关键环节，并可通过更换实际系统数据进行迁移验证，深化对方法泛化能力的理解。
唐白河.zip
11-27
三级水系流域矢量数据，数据格式shp格式，坐标系wgs84，真实可靠可打开，放心使用
51单片机c源码-单片机向PC发送数据
最新发布
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51单片机c源码-单片机向PC发送数据
Image03使用Anroid13的CTP触摸屏驱动来适配Buildroot【linux-5.10】-20251127-1405.7z
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Image03使用Anroid13的CTP触摸屏Buildroot【linux-5.10】_20251127_1405.7z 【请严重注意：非官方适配，仅为学习之用，不承担任何责任！】 【20251120】RD-RK3588开发板适配Android14是全功能模块测试说明2 2025/11/20 18:21 0、DTS使用EVB7的V11版本。EVB7的V10版本应该也类似！ 1、DEBUG波特率：1500000bps 2、HDMI OUT J12有显示。J13没显示。HDMI IN没有输入！ 3、type-C接口，可以ADB，可以刷机。 4、USB接口【全通】！。USB2.0通了。USB HUB通了【4个USB2.0】。USB 3.0通了。 5、AP6275P的WIFI部分【通了，iperf3打流：48.5 Mbits/sec】/BT【通了，接受 小米13Ultra的JPG图片！】。如果不通，可以选择降级固件为Android13中的固件。 6、2个以太网都通了：ETH0【936 Mbits/sec】/ETH1【932 Mbits/sec】。
RH850（RH850/F1L）例程开发参考
11-27
提供了一个资源文件，标题为“RH850（RH850/F1L）例程开发参考”。该资源文件适用于瑞萨（Renesas）RH850系列单片机（特别是RH850/F1L型号）的开发，旨在帮助开发者快速上手并进行相关例程的开发。 资源描述 该资源文件包含了RH850（RH850/F1L）单片机的例程开发参考资料。开发者可以通过这些例程快速了解和掌握RH850系列单片机的编程方法和技巧。资源文件中的例程可以直接在瑞萨的CS+开发环境中使用，无需额外配置或修改。
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