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genetic load

https://www.sohu.com/a/234594093_761120

Genetic drift is a change in allele frequency in a population, due to a random selection of certain genes. Oftentimes, mutations within the DNA can have no effect on the fitness of an organism. These changes in genetics can increase or decrease in a popula

https://blog.youkuaiyun.com/liangbilin/article/details/108977163samtools view -H test.bam | sed -e ‘s/SN:([0-9XY])/SN:chr\1/’ -e ‘s/SN:MT/SN:chrM/’ | samtools reheader - test.bam > test.CHR.bam报错采用 转sam 删除samtools view *.bam -O SAM > *.samsed再转bam报

不同数据库采用的Gene 和 Protein 编号 ID 也不同的, 用不同数据库数据时需要 ID 转换.常用ID 示例ID 来源ENSG00000116717Ensemble IDGA45A_HUMANUniProtKB/Swiss-Prot, entry nameA5PJB2_BOVINUniProtKB/TrEMBL, entry nameA2BC19, P12345, A0A022YWF9UniProt, accession numberGLA

若参考基因组序列不包含chr*random 和 chrUn序列，原来属于chrrandom 和 chrUn的read可能比对到chr1-22，chrX，chrY上相似区域，造成假阳性比对，后续这些reads提供的信息不可靠。通过增加这一部分参考序列，使来自这些区域的reads正确比对，减少假阳性。后续分析不考虑chrrandom 和 chrUn*。human GRCh37“unlocalized sequences”：知道染色体但不知具体位置的序列“unplaced sequences”：知道来自人类

根据DNA marker看条带大小看条带大小是否与目的条带的大小一致看根据条带亮度推测DNA量看PCR引物是否特异，即是否有杂带看是否有引物二聚体判断引物的好坏DNA凝胶电泳标准琼脂糖浓度一般为1.0%。浓度越高，小条带的分辨率越高；琼脂糖浓度越低，大分子量条带的分辨率和分离程度越高。电场中，中性pH值缓冲液（TAE/TBE）下DNA带净负电荷并向凝胶装置正极(+)移动（下图中，上为“-极”至下为“+极”），DNA分子越大所受阻力越大，迁移越慢，500bp的DNA分子比200bp的DNA.