脑白质病变与儿童肥胖内脏脂肪分割的深度学习研究
在医学影像处理领域,深度学习技术正发挥着越来越重要的作用。本文将介绍两种不同的研究,一是关于脑白质病变检测的卷积神经网络,二是针对肥胖儿童内脏脂肪自动分割的方法。
脑白质病变检测的卷积神经网络
在脑白质病变检测方面,研究人员测试了多种卷积神经网络架构,包括MPCNN、ICCNN和DeepMedic。
网络架构调整
- ICCNN :最后一层维度减少到两个神经元,用于指示输入是否为受损体素。训练过程有所改变,使用不平衡数据进行一步训练(每个阳性受损体素对应10个阴性案例)。激活函数改为ReLU,去除了Dropout,并使用二元交叉熵损失函数进行训练。与MPCNN的主要区别在于,ICCNN仅使用2D切片作为输入。
- DeepMedic :架构由3D CNN和全连接的3D条件随机场(CRF)组成。3D CNN有四层,使用5×5×5的内核进行特征提取,分类层是一个1×1×1的卷积层,实现高效的密集推理。该网络有两条路径,分别处理局部信息和更大的上下文信息,实现多尺度数据处理。所有隐藏层都应用了批量归一化(BN),以保持信号并避免权重收敛问题。网络按块训练,批次大小根据输入体素的邻域自动选择。为了适应脑白质病变检测问题,最后一层输出从5个减少到2个。
实验设置
- 实现与训练环境 :MPCNN和ICCNN使用Python和Keras实现,以TensorFlow为后端。DeepMedic的实现从GitHub下载
脑白质病变检测与儿童内脏脂肪分割研究
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