贝叶斯(2)-最大似然估计和贝叶斯参数估计

edgeR/limma/DESeq2差异基因分析→ggplot2作火山图→biomaRt转换ID并注释 请一定看这里:写下来只是为了记录一些自己的实践,当然如果能对你有所帮助那就更好了,欢迎大家和我交流 三者区别 三者区别 差异分析流程: 1 初始数据 2 标准化(normalization):DESeq、TMM等 为什么要标准化? 消除文库大小不同,测序深度对差异分析结果的影响 怎样标准化? 找到一个能反映文库大小的因子,利用这个因子对rawdata进行标准化 3 根据模型检验求p value:泊松分布(poisson distribution)、负二项式分布(NB)等... 阅读详情

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直接统计类条件密度太复杂了且样本不足,所以我们希望用一个密度函数去拟合它,比如拟合成下面的正态分布,其中的参数可以用最大似然方法或者贝叶斯估计去进行参数估计。
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给每个类建模一个密度函数,每个类的函数的参数θ不同;
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假设n个样本独立同分布
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每个样本可以形成一个模型,多个样本多个模型,如图1;取均值得到图2;但是可能会下溢(p很小),所以用log来解决这个问题,也称为似然;
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这里的Σ是协方差;t代表转置,因为x是多维向量;
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极大似然估计就是事先假定一个模型,用样本估计参数;所以对模型的选择依赖性很大,如果模型选错,就达不到最优。
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上面的公式不过是在普通的贝叶斯公式上加了个条件D,在每个概率上都加个D就行。
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没看懂,日后再看几遍吧。。。。。

多方参考,看看这篇博客辅助理解一下链接

机器学习---最大似然估计和贝叶斯参数估计 最大似然估计将参数看作是确定的量,只是其值是未知!通过最大化所观察的样本概率得到最优的。贝叶斯方法把参数当成服从某种先验概率分布的随机变量,对样本进行观测的过程,就是把先验概。率密度转化成为后验概率密度,使得对于每个新样本,后验概率密度函数在待估参数的真实值附近。如果可以将类条件密度参数化,则可以显著降低难度。在以下条件下我们可以设计一个可选择的分类器。在参数估计完后,两种方法都用后验概率。),用两个参数表示,这样就。贝叶斯框架下的数据收集,的正态性,P(x | w。但是方法本质是不同的。 阅读详情

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