CRISPR-detector：快速、准确地检测、可视化和注释基因组编辑事件引起的全基因组范围突变

最新推荐文章于 2025-01-12 21:02:46 发布
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文章标签： Sentieon 基因数据分析 生信服务 变异检测 基因测序
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CRISPR-detector：快速、准确地检测、可视化和注释基因组编辑事件引起的全基因组范围突变

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文献解读-基因编辑-第十二期|《CRISPR-detector：快速、准确地检测、可视化和注释基因组编辑事件引起的全基因组范围突变》
bio2s
06-27 1068
CRISPR-detector提供了几项关键创新，包括通过允许WGS数据分析来提高可扩展性，以及通过基于单倍型的变体调用来处理测序错误来提高准确性。
Nature：基因组编辑工具CRISPR的进化史
AIPuFu的博客
12-07 1290
CRISPR tool enables precise genome editing 作者：Randall J. Platt 基因组编辑的最终目标是能够对生命蓝图做出任何具体的改变。基因组编辑的“搜索-替换”方法使我们朝着这个宏伟目标迈出了一大步。 构成生命蓝图的脱氧核糖核酸序列的变异对任何物种的适应性都是至关重要的，然而成千上万的脱氧核糖核酸变异被认为会导致疾病。经过几十年的遗传学和分子生物学...
CRISPR-GPT: Google 领军自动化基因编辑LLM Agent
Hofong1966的博客
04-30 1486
当大家还在讨论AI是否能进行复杂推理的时候,另一个有"破坏力创造"的进步却在悄然发生。那就是AI与基因编辑技术的结合!! 我曾经参与生物芯片公司的运营, 所以从实务上深入分析这个应用带来的影响, 但是如果产业知识对您过于艰涩, 您可以直接看我的结论。 基因工程技术的引入彻底改变了生物医学研究,使得对基因信息进行精确修改成为可能。然而,创建一个高效的基因编辑系统需要对CRISPR技术和复杂的实验系统有深入的理解。虽然大型语言模型(LLM)在各种任务中表现出了前景,但它们往往缺乏特定知识,难以准确解决生物学
论文阅读笔记(十)——CRISPR-GPT: An LLM Agent for Automated Design of Gene-Editing Experiments
saltfish920的博客
05-29 2254
基因组工程技术的引入改变了生物医学研究，使得对遗传信息进行精确修改成为可能。然而，创建一个高效的基因编辑系统需要对CRISPR技术和复杂的实验系统有深入的了解。尽管大语言模型（LLMs）在各种任务中表现出了前景，但它们往往缺乏特定知识，难以准确解决生物设计问题。在这项工作中，我们介绍了CRISPR-GPT，这是一个增强了领域知识和外部工具的大语言模型代理，用于自动化和增强基于CRISPR的基因编辑实验的设计过程。
使用异构计算优化基因编辑工具CRISPR-Cas9的脱靶效应检测效率的技术详解
qq_36287830的博客
01-12 840
CRISPR-Cas9系统源自细菌天然免疫机制，它能够特异性地定位并切割入侵病毒或质粒中的特定序列。科学家们改造了这套系统，使其可以被编程用于人类细胞内的精准基因编辑。异构计算是指在同一系统内同时使用多种类型的处理器（如CPU、GPU、FPGA等）协同工作。通过发挥各自优势，可以在性能、功耗等方面取得更好的平衡。
CRISPRCasFinder：注释基因组序列中的CRISPR-Cas
m0_53945548的博客
05-13 771
【代码】CRISPRCasFinder：注释基因组序列中的CRISPR-Cas。
crispr-cas9基因编辑技术最新进展（2021年1月-2月）
Bio12345的博客
02-26 4202
即将过去的1月份，有哪些重大的CRISPR/Cas研究或发现呢？小编梳理了一下这个月生物谷报道的CRISPR/Cas研究方面的新闻，供大家阅读。 1.Science论文详解！基于CRISPR/Cas9的单细胞谱系追踪，揭示癌症异种移植物转移的速率、途径和驱动因子 doi:10.1126/science.abc1944 当癌症局限于身体的一个部位时，医生通常可以通过手术或其他疗法进行治疗。然而，大部分与癌症有关的死亡，是由于它的转移倾向，发送自己的种子（癌细胞），可能在全身生根。转移的确切时刻转瞬即逝，混杂
CRISPR最新：新CRISPR技术靶向更复杂的人类基因组代码
Bio12345的博客
02-26 375
Rice大学的研究人员通过一种新的基因组编辑工具取得了类似的成就，这种工具的目标是细胞核中的辅助角色，这些角色负责包装DNA并帮助基因表达。他们的工作为癌症和其他疾病的新疗法打开了大门。 Rice生物工程师Isaac Hilton，第一作者Jing Li博士后研究员和他们的同事设计了一个改良的CRISPR/Cas9复合物，以靶向特定的组蛋白。 组蛋白有助于调节许多细胞过程。每个核小体中有四个（DNA中基本的“串珠”），通过暴露基因进行激活，帮助控制我们基因组的结构和功能。 Hilton..
AbMole|基于高容量腺病毒载体和 CRISPR-Cas9 核酸酶的大规模基因组编辑
AbMole的博客
09-09 1142
然后，他们构建了用于产生纤维修饰的 AdVPs 的分子克隆，包括编码与 EGFP 融合的人全长抗肌萎缩蛋白的构建体（EGFP::DYS）和含有合成的 436 - bp 横纹肌特异性 CK8 启动子的构建体等，并对产生的 AdVPs 进行了纯化和表征。一篇发表在《Nucleic Acids Research》的研究论文引起了广泛关注，这篇论文展示了一种基于高容量腺病毒载体（AdVPs）和 CRISPR-Cas9 核酸酶的大规模基因组编辑技术，为杜氏肌营养不良（DMD）的治疗带来了新的突破。
matlab代码不反应-CRISPR-TN5:用于CRISPR介导的基因组编辑无偏测序的分析代码
05-26
该代码分析了双核酸酶（例如CRISPR）的基因组编辑结果，以靶向删除DNA区域。 分析还包括两个AAV矢量基因组可以查询有意或无意的靶向整合的空间（请参阅参数文件）。 图1-多重基因组编辑的可能结果 基于Tn5的浓缩如何...
基因编辑CRISPR-mRNA联用敲除CEACAM6基因增强乳腺细胞免疫：乳腺炎防治新策略
05-11
内容概要：本文探讨了CRISPR-mRNA联用技术在乳腺细胞基因编辑增强型免疫中的应用，特别是针对金黄色葡萄球菌引发的乳腺炎。研究背景指出金黄色葡萄球菌是乳腺炎的主要病原体，传统抗生素治疗效果有限且存在耐药性...
CRISPR-Offinder:CRISPR指导RNA设计和脱靶搜索-开源
04-29
此外，CRISPR-offinder可以通过脱靶位点数量找到基因组中的候选sgRNA并对其进行排名，还可以用于设计单个或成对的gRNA。 CRISPR-offinder可作为命令行程序免费获得，也可通过我们的网站进行访问。 可用性：CRISPR-...
MAGeCK:全基因组CRISPR-Cas9敲除的基于模型的分析-开源
04-29
全基因组CRISPR-Cas9敲除（MAGeCK）的基于模型的分析是一种计算工具，可从最新的基因组规模CRISPR-Cas9敲除筛选技术中识别重要基因。 有关说明和文档，请参阅Wiki页面。 MAGeCK是由达纳-法伯癌症研究所/哈佛大学公共...
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06-16
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星际争霸地图加密：CTF中SCM文件的结构化数据提取.pdf
06-16
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多阶段S盒混淆：CTF自定义AES算法的差分能量分析.pdf
06-16
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Playfair密码的残缺棋盘：CTF中缺失字母表的填充与破解.pdf
06-16
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深度伪造检测：CTF中AI生成内容的隐写加密双重挑战.pdf
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我的字节跳动Android面试初体验——稀里糊涂结束战斗.docx
06-16
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