CRISPR-detector：快速、准确地检测、可视化和注释基因组编辑事件引起的全基因组范围突变

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#Sentieon #基因数据分析 #生信服务 #变异检测 #基因测序

CRISPR-detector：快速、准确地检测、可视化和注释基因组编辑事件引起的全基因组范围突变

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文献解读-基因编辑-第十二期|《CRISPR-detector：快速、准确地检测、可视化和注释基因组编辑事件引起的全基因组范围突变》
bio2s
06-27 1144
CRISPR-detector提供了几项关键创新，包括通过允许WGS数据分析来提高可扩展性，以及通过基于单倍型的变体调用来处理测序错误来提高准确性。
论文阅读笔记(十)——CRISPR-GPT: An LLM Agent for Automated Design of Gene-Editing Experiments
saltfish920的博客
05-29 2526
基因组工程技术的引入改变了生物医学研究，使得对遗传信息进行精确修改成为可能。然而，创建一个高效的基因编辑系统需要对CRISPR技术和复杂的实验系统有深入的了解。尽管大语言模型（LLMs）在各种任务中表现出了前景，但它们往往缺乏特定知识，难以准确解决生物设计问题。在这项工作中，我们介绍了CRISPR-GPT，这是一个增强了领域知识和外部工具的大语言模型代理，用于自动化和增强基于CRISPR的基因编辑实验的设计过程。
CRISPR-GPT: Google 领军自动化基因编辑LLM Agent
Hofong1966的博客
04-30 1755
当大家还在讨论AI是否能进行复杂推理的时候,另一个有"破坏力创造"的进步却在悄然发生。那就是AI与基因编辑技术的结合!! 我曾经参与生物芯片公司的运营, 所以从实务上深入分析这个应用带来的影响, 但是如果产业知识对您过于艰涩, 您可以直接看我的结论。 基因工程技术的引入彻底改变了生物医学研究,使得对基因信息进行精确修改成为可能。然而,创建一个高效的基因编辑系统需要对CRISPR技术和复杂的实验系统有深入的理解。虽然大型语言模型(LLM)在各种任务中表现出了前景,但它们往往缺乏特定知识,难以准确解决生物学
使用异构计算优化基因编辑工具CRISPR-Cas9的脱靶效应检测效率的技术详解
qq_36287830的博客
01-12 1169
CRISPR-Cas9系统源自细菌天然免疫机制，它能够特异性地定位并切割入侵病毒或质粒中的特定序列。科学家们改造了这套系统，使其可以被编程用于人类细胞内的精准基因编辑。异构计算是指在同一系统内同时使用多种类型的处理器（如CPU、GPU、FPGA等）协同工作。通过发挥各自优势，可以在性能、功耗等方面取得更好的平衡。
CRISPRCasFinder：注释基因组序列中的CRISPR-Cas
m0_53945548的博客
05-13 1068
【代码】CRISPRCasFinder：注释基因组序列中的CRISPR-Cas。
crispr-cas9基因编辑技术最新进展（2021年1月-2月）
Bio12345的博客
02-26 4337
即将过去的1月份，有哪些重大的CRISPR/Cas研究或发现呢？小编梳理了一下这个月生物谷报道的CRISPR/Cas研究方面的新闻，供大家阅读。 1.Science论文详解！基于CRISPR/Cas9的单细胞谱系追踪，揭示癌症异种移植物转移的速率、途径和驱动因子 doi:10.1126/science.abc1944 当癌症局限于身体的一个部位时，医生通常可以通过手术或其他疗法进行治疗。然而，大部分与癌症有关的死亡，是由于它的转移倾向，发送自己的种子（癌细胞），可能在全身生根。转移的确切时刻转瞬即逝，混杂
全基因组CRISPR敲除文库筛选：功能基因组学研究的革新性工具与前沿应用
2301_80746785的博客
07-25 1298
CRISPR文库筛选技术是基因功能研究的重要工具，通过sgRNA文库设计、细胞转染、表型筛选和测序分析等步骤，实现高通量基因功能鉴定。该技术已成功应用于HIV宿主因子鉴定、免疫细胞调控网络解析和细菌必需基因研究等领域，为疾病机制探索和药物靶点发现提供新思路。其高效、精准的特点推动了生命科学研究的深入发展，在基础研究和临床应用方面展现出广阔前景。
Nature：基因组编辑工具CRISPR的进化史
AIPuFu的博客
12-07 1323
CRISPR tool enables precise genome editing 作者：Randall J. Platt 基因组编辑的最终目标是能够对生命蓝图做出任何具体的改变。基因组编辑的“搜索-替换”方法使我们朝着这个宏伟目标迈出了一大步。 构成生命蓝图的脱氧核糖核酸序列的变异对任何物种的适应性都是至关重要的，然而成千上万的脱氧核糖核酸变异被认为会导致疾病。经过几十年的遗传学和分子生物学...
CRISPR最新：新CRISPR技术靶向更复杂的人类基因组代码
Bio12345的博客
02-26 404
Rice大学的研究人员通过一种新的基因组编辑工具取得了类似的成就，这种工具的目标是细胞核中的辅助角色，这些角色负责包装DNA并帮助基因表达。他们的工作为癌症和其他疾病的新疗法打开了大门。 Rice生物工程师Isaac Hilton，第一作者Jing Li博士后研究员和他们的同事设计了一个改良的CRISPR/Cas9复合物，以靶向特定的组蛋白。 组蛋白有助于调节许多细胞过程。每个核小体中有四个（DNA中基本的“串珠”），通过暴露基因进行激活，帮助控制我们基因组的结构和功能。 Hilton..
matlab代码不反应-CRISPR-TN5:用于CRISPR介导的基因组编辑无偏测序的分析代码
05-26
该代码分析了双核酸酶（例如CRISPR）的基因组编辑结果，以靶向删除DNA区域。 分析还包括两个AAV矢量基因组可以查询有意或无意的靶向整合的空间（请参阅参数文件）。 图1-多重基因组编辑的可能结果 基于Tn5的浓缩如何...
基因编辑CRISPR-mRNA联用敲除CEACAM6基因增强乳腺细胞免疫：乳腺炎防治新策略
05-11
内容概要：本文探讨了CRISPR-mRNA联用技术在乳腺细胞基因编辑增强型免疫中的应用，特别是针对金黄色葡萄球菌引发的乳腺炎。研究背景指出金黄色葡萄球菌是乳腺炎的主要病原体，传统抗生素治疗效果有限且存在耐药性...
纳米机器人基因编辑载具制造技术方案详解：CRISPR-Cas9低温保存工艺与细胞核膜穿透肽修饰方案(406页).pdf
02-02
该文档【纳米机器人基因编辑载具制造技术方案详解：CRISPR-Cas9低温保存工艺与细胞核膜穿透肽修饰方案】共计 406 页，共50个大章节，文档支持目录章节跳转同时还支持阅读器左侧书签大纲显示和章节快速定位，文档内容...
【电力系统潮流】5节点系统潮流计算-牛拉法和PQ分解法（Matlab代代码实现）
最新发布
11-26
【电力系统潮流】5节点系统潮流计算-牛拉法和PQ分解法（Matlab代代码实现）内容概要：本文介绍了基于Matlab实现的5节点电力系统潮流计算，重点采用牛顿-拉夫逊法（牛拉法）和PQ分解法两种经典算法进行求解。文档详细阐述了两种方法的数学模型、迭代过程及收敛特性，并通过Matlab代码实现对同一测试系统进行仿真分析，对比了两种算法在计算精度、收敛速度和编程复杂度方面的差异。文中包含完整的代码结构、关键函数说明以及运行结果展示，有助于理解电力系统潮流计算的基本原理与数值方法的应用。; 适合人群：电力系统相关专业的本科生、研究生及从事电力系统分析与仿真的科研人员和技术工程师。; 使用场景及目标：①掌握牛顿-拉夫逊法和PQ分解法在电力系统潮流计算中的具体实现过程；②通过Matlab编程加深对潮流算法迭代机制、雅可比矩阵构建与节点分类的理解；③用于教学演示、课程设计或科研项目中作为基础算法参考。; 阅读建议：建议读者结合电力系统分析基础知识，先理解算法原理再逐步调试代码，重点关注节点导纳矩阵的形成、功率偏差计算与修正方程求解环节，同时可通过修改系统参数验证算法稳定性与适用范围。
基于51单片机的直流电机调速测速正反转控制
11-26
基于51单片机，实现对直流电机的调速、测速以及正反转控制。项目包含完整的仿真文件、源程序、原理图和PCB设计文件，适合学习和实践51单片机在电机控制方面的应用。 功能特点 调速控制：通过按键调整PWM占空比，实现电机的速度调节。 测速功能：采用霍尔传感器非接触式测速，实时显示电机转速。 正反转控制：通过按键切换电机的正转和反转状态。 LCD显示：使用LCD1602液晶显示屏，显示当前的转速和PWM占空比。 硬件组成 主控制器：STC89C51/52单片机（与AT89S51/52、AT89C51/52通用）。 测速传感器：霍尔传感器，用于非接触式测速。 显示模块：LCD1602液晶显示屏，显示转速和占空比。 电机驱动：采用双H桥电路，控制电机的正反转和调速。 软件设计 编程语言：C语言。 开发环境：Keil uVision。 仿真工具：Proteus。 使用说明 液晶屏显示： 第一行显示电机转速（单位：转/分）。 第二行显示PWM占空比（0~100%）。 按键功能： 1键：加速键，短按占空比加1，长按连续加。 2键：减速键，短按占空比减1，长按连续减。 3键：反转切换键，按下后电机反转。 4键：正转切换键，按下后电机正转。 5键：开始暂停键，按一下开始，再按一下暂停。 注意事项 磁铁和霍尔元件的距离应保持在2mm左右，过近可能会在电机转动时碰到霍尔元件，过远则可能导致霍尔元件无法检测到磁铁。 资源文件 仿真文件：Proteus仿真文件，用于模拟电机控制系统的运行。 源程序：Keil uVision项目文件，包含完整的C语言源代码。 原理图：电路设计原理图，详细展示了各模块的连接方式。 PCB设计：PCB布局文件，可用于实际电路板的制作。
基于OPPO竞赛的本科毕业论文开源实现方案
11-26
本资源包所含程序代码均已完成全面质量检测，各项功能模块运行状态稳定可靠。针对技术实现层面的疑问或系统架构讨论，用户可通过站内通信渠道提交问题，项目维护团队将在24小时内予以专业解答。 该资源包主要面向计算机学科教育应用场景，特别适用于高等院校的毕业设计项目开发、课程实践任务等教学需求。在人工智能、计算机科学与技术等专业方向的教学实践中，该资源包提供的算法实现案例和工程框架具有显著参考价值。 使用者获取资源后，建议优先查阅项目文档中的README技术说明文件（若存在），其中详细记载了环境配置要求、依赖组件清单及部署流程等关键技术参数。需要特别声明的是，本资源包所有内容仅限于技术交流与学术研究范畴，严格禁止任何形式的商业性应用或二次销售行为。所有源代码及文档资料的知识产权均受相关法律法规保护。 资源来源于网络分享，仅用于学习交流使用，请勿用于商业，如有侵权请联系我删除！
2025 AI赋能能源系统：解锁可持续AI 助力韧性能源转型研究报告.pdf
11-26
2025 AI赋能能源系统：解锁可持续AI 助力韧性能源转型研究报告
C# winform yolov11-onnx实例分割模型部署源码.zip
11-26
【测试环境】 vs2019 net framework4.7.2 opencvsharp4.8.0 onnxruntime1.16.3 视频演示：https://www.bilibili.com/video/BV1yu1qYaE5K/ 博文地址：https://blog.youkuaiyun.com/FL1623863129/article/details/142727953
【四旋翼无人机】具备螺旋桨倾斜机构的全驱动四旋翼无人机：建模与控制研究（Matlab代码、Simulink仿真实现）
11-26
【四旋翼无人机】具备螺旋桨倾斜机构的全驱动四旋翼无人机：建模与控制研究（Matlab代码、Simulink仿真实现）内容概要：本文围绕具备螺旋桨倾斜机构的全驱动四旋翼无人机展开研究，重点进行了系统建模与控制策略的设计与仿真验证。通过引入螺旋桨倾斜机构，该无人机能够实现全向力矢量控制，从而具备更强的姿态调节能力和六自由度全驱动特性，克服传统四旋翼欠驱动限制。研究内容涵盖动力学建模、控制系统设计（如PID、MPC等）、Matlab/Simulink环境下的仿真验证，并可能涉及轨迹跟踪、抗干扰能力及稳定性分析，旨在提升无人机在复杂环境下的机动性与控制精度。; 适合人群：具备一定控制理论基础和Matlab/Simulink仿真能力的研究生、科研人员及从事无人机系统开发的工程师，尤其适合研究先进无人机控制算法的技术人员。; 使用场景及目标：①深入理解全驱动四旋翼无人机的动力学建模方法；②掌握基于Matlab/Simulink的无人机控制系统设计与仿真流程；③复现硕士论文级别的研究成果，为科研项目或学术论文提供技术支持与参考。; 阅读建议：建议结合提供的Matlab代码与Simulink模型进行实践操作，重点关注建模推导过程与控制器参数调优，同时可扩展研究不同控制算法的性能对比，以深化对全驱动系统控制机制的理解。
基于知识图谱的《红楼梦》人物关系可视化与问答系统实现：LTP命名实体识别与关系抽取应用
11-26
app.py作为系统的主要启动文件，承担程序运行的初始化功能。templates目录包含所有用户界面文件，其中index.html实现系统欢迎页面的展示，search.html提供人物关系检索功能，all_relation.html呈现完整的人物关系网络，KGQA.html则用于处理基于知识图谱的问答交互。static资源目录集中管理前端样式文件与交互脚本，包含CSS样式表和JavaScript功能代码。 数据处理模块raw_data负责存储经过预处理的结构化三元组数据。知识图谱构建模块neo_db包含多个功能组件：config.py统一管理系统配置参数，create_graph.py实现图数据库的初始化构建，query_graph.py提供图谱数据查询服务。KGQA问答模块整合了自然语言处理功能，ltp.py专门负责文本分词、词性标注与命名实体识别等语言分析任务。 网络爬虫模块spider包含多个数据采集组件，其中get_*.py系列文件专门用于获取人物相关信息，并已完成图像数据的采集工作。各模块之间通过标准化接口进行数据交互，形成完整的知识图谱构建与查询体系。系统采用分层架构设计，前后端分离的开发模式确保了功能模块的可维护性和扩展性。数据流经过严格规范化处理，从原始数据采集到最终可视化展示形成完整闭环。 资源来源于网络分享，仅用于学习交流使用，请勿用于商业，如有侵权请联系我删除！
CRISPR-TN5：基于MATLAB的基因组编辑测序分析工具
CRISPR-TN5项目是一套基于MATLAB开发的生物信息学分析工具，专门用于解析由CRISPR-Cas系统介导的基因组编辑事件所产生的复杂序列变化。该代码的核心目标是通过高通量测序数据（特别是Illumina平台生成的.fastq或....
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