Sentieon软件发布202112.06版本更新

Sentieon发布了202112.06版本,该版本增强了对UMIbarcode的支持,提升了DNAseq、RNAseq等多种基因数据的NGS分析效率和计算精度。新功能包括LocusCollector和Dedup算法支持,UMIbarcode纠错,多平台gVCF合并,以及对LongReadSV算法的更新,支持PacBioHiFi和OxfordNanopore数据处理。此外,修复了一些已知问题,如在某些情况下可能导致segmentation fault的问题。

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Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2等金标准的数学模型,在保证完全匹配开源分析方案结果的前提下,计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据NGS分析效率和计算精度。

Sentieon持续为业界提供高性能的NGS数据分析软件。我们根据用户的需求与反馈,持续迭代改进Sentieon软件包,三代长读长的变异检测工具是我们近期开发的重点。2022年11月9日,Sentieon推出了最新的202112.06版本,具体更新信息如下:

202112.06版本主要新增功能如下:

  1. 新版添加了对 LocusCollector 和 Dedup 算法的支持,以执行涉及UMI barcode的重复数删除;
  2. 更新了Dedup模块算法,以支持对UMI barcode的纠错功能;
  3. 更新了GVCFtyper模块功能,用户可以将从多个测序平台获得的DNAscope gVCF合并到单个多样本VCF中;
  4. 在 GVCFtyper 中添加了对没有 PL 字段的 gVCF 文件的支持;
  5. 更新了LongReadSV算法,现在可以同时支持PacBio HiFi和Oxford Nanopore长读长数据处理。

修复BUG

  • Solved issue in umi consensus that could cause a segmentation fault when input has 0-length read…
  • Solved issue in GVCFtyper that would produce <NON_REF> alleles under rare circumstances…
  • Solved issue that Plot GCBias was left-shifted on some datasets.

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