3、大数据显微镜实验中的Web图像分析处理方案

大数据显微镜实验中的Web图像分析处理方案

1. 大数据显微镜实验的挑战与Web图像处理管道的价值

1.1 Web图像处理管道的优势

在大数据显微镜实验中，实现可重复的科学研究是一项艰巨的任务。Web图像处理管道（WIPP）能够提供远程“随时随地”的访问，以及可定制、可扩展和灵活的计算工具，用于探索和建模。基于服务器的图像测量还能将计算来源信息整合到Web系统中，有助于追溯中间结果和共享图像。不过，软件开发成本、数据存储硬件成本以及Web系统维护人力成本，会在一定程度上抵消这种优势。因此，在采用开源Web图像处理管道时，需要综合权衡协作建模、数据共享、计算资源可扩展性和计算来源等方面的收益，与硬件、额外软件和维护人力成本。

1.2 WIPP对科研的促进作用

WIPP可被视为一种有用的数据科学基础设施工具，能够推动大数据实验中的发现，并促进科研成果的发表。它对研究人员和从业者的好处在于提高科学生产力和提供可重复的结果。从发现的角度来看，WIPP在从当前的微观测量向未来的宏观 - 微观测量转变中发挥着重要作用。从发表的角度来看，如果研究人员不必担心“大数据”问题，如计算机配置、软件与数据规模的适配、中间结果的跟踪、算法参数的选择以及发表材料与数据点的关联，那么对药物治疗下细胞反应的理解将能更快取得进展。具有可追溯结果的出版物还能让审稿人更高效、客观地进行评审。

1.3 微观测量的转变

角色	当今微观测量	未来宏观 - 微观测量