生物信息学与计算生物学:从历史到未来的探索
在当今的生物学领域,计算生物学和生物信息学正发挥着越来越重要的作用。它们不仅为生物研究提供了强大的工具,还推动了整个领域的发展。本文将深入探讨这两个领域的历史、现状以及未来的发展趋势。
1. 生物信息学与计算生物学的简史
生物信息学和计算生物学的起源可以追溯到20世纪中叶。1953年,Frederick Sanger完成了首个蛋白质测序工作,并于1958年因在蛋白质结构研究方面的贡献获得诺贝尔化学奖。1960年,Max Perutz和John Kendrew进行了首次蛋白质晶体结构分析,他们也在1962年因使用X射线晶体学确定蛋白质的原子结构而获得诺贝尔化学奖。这些早期的重要数据集为计算生物学和生物信息学的发展奠定了基础。
John Kendrew利用1949年在英国剑桥建立的第一台欧洲计算机ESDAC,从X射线衍射数据中计算肌红蛋白的结构。因此,他可以被视为化学信息学的创始人之一。与此同时,1951年John William Mauchly和John Presper Eckert开发了第一台商业可用的计算机UNIVAC I,1956年IBM员工John Backus用Fortran开发了第一种编译型编程语言。
Margaret Oakley Dayhoff是生物信息学的先驱之一。20世纪60年代初,她使用Fortran语言编写程序,从序列片段中确定完整的蛋白质序列。后来,Craig Venter领导的团队建立了全基因组鸟枪法测序方法,用于组装完整的基因组。这种方法在1995年用于测序第一个自由生活细菌的基因组,并在2001年用于塞雷拉基因组公司对人类基因组的测序。
20世纪70年代,Margar
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