Scipy三维和更高维插值

本文深入解析了如何使用Scipy库中的interpn函数进行三维及更高维度的插值计算。通过具体示例,详细介绍了参数设置,包括points、values、xi等,以及方法method的选择。同时探讨了bounds_error和fill_value选项在处理边界情况时的作用。

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Scipy三维插值

插值运算在科学计算任务中非常常见,而scipy又是使用python进行科学计算任务的必备工具之一。关于如何使用scipy进行一位和二维插值官方文档介绍的已经非常详细,基本上根据demo操作就能搞清楚怎么使用scipy进行一维和二维插值。但是有时发现自己需要使用scipy进行三维和更高维插值,然而官方文档对于如何进行高维插值介绍的十分简略,很难看懂,这里详细分析一下怎么使用scipy.interpolate.interpn实现n维插值。

1.官方文档介绍

scipy.interpolate.interpn(
points,
values,
xi,
method='linear', 
bounds_error=True, 
fill_value=nan)

points:形如 (m1, ), …, (mn, )numpy浮点数组元组,用来定义n维插值的空间,每个元素相当于一个维度坐标轴上已知数据点的坐标值,比如三维插值,传入元组的三个元素代表已知数据点在x,y,z三个坐标轴上的坐标值,这里看不懂可以看示例。

values:类似于数组,形如 (m1,…,mn) 的已知数据点对应的值,和point在每个维度上一一对应,表示已知数据点的值。

xinnumpy数组,和point在维度上一一对应,表示需要获取值的点在每个维度上的坐标值,如果是三维,表明你传入的是坐标(x,y,z),希望得到f(x,y,z)。

method : 插值实现方法,和一维、二维类似,一般由 linearnearest等插值方法。

bounds_error: 当传入的 xi某个或者多个坐标值不在给定插值空间(空间范围由 points每个维度上的最大和最小值划定)中时是否抛出错误,默认 True,如果设置为 False,当 fill_valueFalse,将会返回 numpy NAN值。

fill_value :设置为 True,当 xi不在给定插值空间时,根据一定的算法的计算出某个值,如果 xi 距离给定插值空间比较远,通常这个值误差很大。

示例

import numpy as np
from scipy.interpolate import interpn

# 维度1x2
x_p = np.array([0.1, 0.5])
# 维度1x3
y_p = np.arange(0, 3, 1)
# 维度1x16
z_p = np.arange(2, 10, 0.5)
# points必须是递增序列
points = (
    # 第一维变量x采样点
    x_p,
    # 第二维变量y采样点
    y_p,
    # 第三维变量z采样点
    z_p
)
# f(x,y,z)采样值
# 维度2x3x16,对应points中的维度
values = np.array([
    np.array([np.linspace(1, 29, 16), np.linspace(8, 50, 16), np.linspace(100, 200, 16)]),
    np.array([np.linspace(5, 28, 16), np.linspace(6, 74, 16), np.linspace(30, 210, 16)])
])
# 插值查询点xi,yi,zi
xi = [0.2, 3, 3.6]
# 插值
res = interpn(
    points,
    values, xi,
    # 外插时自动填充值,而不是nan
    fill_value=True,
    # 允许外插
    bounds_error=False,
    method='linear')
print(res[0])
### Python 中用于不规则插值的方法和库 在处理不规则数据时,Python 提供了一些强大的方法和库来实现插值功能。以下是几个常用的工具及其特点: #### SciPy 的 `griddata` 方法 SciPy 是一个广泛使用的科学计算库,在其子模块 `scipy.interpolate` 中提供了 `griddata` 函数,可以用来执行不规则网格上的多插值[^4]。该函数支持线性、最近邻以及次样条插值。 ```python from scipy.interpolate import griddata import numpy as np # 假设我们有一些不规则分布的数据点 points = np.random.rand(100, 3) # 不规则的 (x,y,z) 数据点 values = np.sin(points[:, 0]) * np.cos(points[:, 1]) * points[:, 2] # 定义目标网格 xi = yi = zi = np.linspace(-1, 1, 50) XI, YI, ZI = np.meshgrid(xi, yi, zi) # 执行插值 interpolated_values = griddata(points, values, (XI, YI, ZI), method='linear') ``` 此代码片段展示了如何利用 `griddata` 对不规则数据进行插值操作[^4]。 #### PyKrige 库 如果需要更复杂的克里金(Kriging)插值算法,则可以考虑使用专门设计的地统计学软件包 **PyKrige**。虽然它主要用于二空间中的地质数据分析,但也能够扩展到更高度的情况[^5]。 安装命令如下所示: ```bash pip install pykrige ``` 尽管如此,对于纯粹的情况来说,可能还需要额外的工作才能适应特定需求。 #### Rbf 径向基函数(RBF) 插值法 另一种选择是从径向基函数出发构建自定义解决方案。同样来自 Scipy 的另一个选项叫做 `Rbf`(Radial Basis Function),它可以很好地适用于任意形状的空间分布问题[^6]。 下面是一个简单的例子说明它的应用方式: ```python from scipy.interpolate import Rbf rbf_instance = Rbf(x_data, y_data, z_data, func_value, function='multiquadric') new_x = ... new_y = ... new_z = ... predicted_func_val_at_new_point = rbf_instance(new_x, new_y, new_z) ``` 这里需要注意的是不同的核函数可能会带来截然不同的效果表现,因此建议依据实际应用场景挑选合适的类型。 ---
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