25、SeqAn3输入/输出模块深度解析

SeqAn3输入/输出模块深度解析

在生物信息学的序列分析领域，输入/输出（I/O）操作是基础且关键的环节。下面将深入介绍SeqAn3中的I/O模块，涵盖其各个子模块、功能特性及使用方法。

1. I/O模块概述

I/O模块包含多个子模块，以及一些异常类型、枚举类型和其他类类型，具体如下表所示：
| 类别 | 详情 |
| — | — |
| 子模块 | 对齐文件、序列文件、流、结构文件 |
| 异常类型 | seqan3::file_open_error、seqan3::format_error、seqan3::io_error、seqan3::parse_error、seqan3::unexpected_end_of_input、seqan3::unhandled_extension_error |
| 枚举类型 | seqan3::field |
| 其他类类型 | seqan3::fields、seqan3::record |

2. 流子模块

流子模块的大部分内容位于 seqan3::detail:: 命名空间中，是辅助功能。以下是其重要部分的介绍：
- seqan3::views::istreambuf ：允许将流当作范围使用，该视图是单遍的，若要再次解析流，需要重置流并创建新的视图。

graph LR
    A[输入流] --> B[seqan3::views::istreambuf]