字母表模块:概念、自定义与核苷酸子模块详解
1. 字母表模块基础操作与概念
1.1 基础函数操作
seqan3::assign_char_strictly_to(c, alph) 函数用于通过字符赋值来改变 alph 的值。它是一个函数对象,但其语义完全由其他自定义点对象(CPO)提供,因此不能被自定义。该函数的执行流程如下:
1. 调用 seqan3::char_is_valid_for<decltype(alph)>(c) 检查字符 c 是否对 alph 有效。
2. 如果结果为 false ,则抛出异常;否则,调用 seqan3::assign_char_to(c, alph) 。
这个函数适用于不希望进行静默转换为有效值的情况,并且它是唯一实现中必须包含分支( if 检查)且不能标记为 noexcept 的基本操作。
1.2 字母表概念设计
在泛型编程中使用字母表并实现多态性,需要定义 C++ 概念来涵盖典型和更精细的用例。设计概念时,应基于实际用例而非紧密依赖所设计类型的接口。
在 C++ 中, T 、 T & 、 T const & 等都是不同的类型,一个类型可能满足某个概念,但相关类型不一定满足。例
字母表模块详解:自定义与核苷酸子模块应用
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