热蛋白质组分析（TPP）与多组学技术整合：揭示复杂分子机制的协同策略

原创 已于 2025-06-06 10:10:00 修改 · 760 阅读 · 18 ·
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#TPP实验 #转录组学 #磷酸化蛋白质组学 #分子机制

于 2025-04-17 11:29:31 首次发布

更多详细信息请见：最经典、主流的药物靶点筛选技术——TPP热蛋白组分析

热蛋白质组分析（Thermal Proteome Profiling, TPP） 是一种基于质谱（Mass Spectrometry, MS）的功能性蛋白质组学技术，通过检测蛋白质在不同温度下的热稳定性变化，揭示蛋白质的结构和功能状态。TPP的独特之处在于，它不仅能够反映蛋白质的表达量变化，还能捕捉蛋白质因翻译后修饰、复合物形成或药物结合等引起的结构变化。这种技术为研究蛋白质功能动态变化提供了一个全新的视角，并在药物作用机制、疾病机制和信号传导研究中展现出巨大的应用潜力。

一、TPP与其他组学技术的结合

TPP的独特优势在于其能够与转录组学（Transcriptomics）、磷酸化蛋白质组学（Phosphoproteomics）等其他组学技术结合，提供多层次的分子信息。通过整合多组学数据，研究人员可以从不同维度揭示复杂生物过程的分子机制。例如，在研究PARP抑制剂（如Olaparib）对卵巢癌细胞的

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TPP与蛋白质翻译后修饰：开启蛋白质研究的新维度
Specally的博客
04-07 1108
TPP（Thermal Proteome Profiling）实验又名热蛋白组学分析，是一种基于热稳定性的蛋白质组学分析技术，通过测量蛋白质在不同温度下的热稳定性变化，揭示蛋白质与小分子药物、代谢物或其他分子的相互作用。TPP实验与蛋白质翻译后修饰的结合为研究蛋白质的动态行为和功能调控提供了强大的工具。通过揭示PTM对蛋白质热稳定性的影响，TPP实验能够深入解析蛋白质的功能调控机制，并在药物研发、疾病机制解析和蛋白质功能研究中展现出广阔的应用前景。为研究蛋白质的动态行为和功能调控提供了独特的视角。
热蛋白质组学分析技术在现代生命科学中的应用领域探析
Specally的博客
06-18 794
在生物医学研究领域，TPP助力科学家深入揭示疾病的分子机制，从蛋白质异构体的细微差异到金属离子调控的复杂网络，再到代谢物对关键酶活性的调控，不断刷新我们对疾病发生发展的认知，并为新型生物标志物的发现提供了丰富的源泉。借助高分辨率的定量质谱技术，TPP能够同时监测细胞裂解液、完整细胞乃至组织样本中成千上万种蛋白质的热稳定性变化，这种全景式的扫描使得研究者能够无偏倚地发现药物的直接靶点、脱靶靶点，以及由这些直接相互作用引发的下游蛋白质稳定性改变，从而揭示复杂的生物学效应网络。TPP的根本出发点是。
13、甘蔗渗透保护基因分析：应对环境胁迫的分子机制
uran的专栏
06-18 62
本博文探讨了甘蔗在应对环境胁迫（如干旱和盐碱化）时的分子机制，重点分析了与渗透保护剂合成和积累相关的基因。通过数据挖掘和基因识别技术，研究人员揭示了关键基因（如P5CS、P5CR、TPP和TPS）的功能及其在不同胁迫条件下的表达变化。此外，还进行了系统发育分析，并提出了未来研究方向，包括基因编辑技术和多组学整合分析的应用。
6、蛋白质亚细胞定位预测与甘蔗渗透保护剂的研究进展
open4的博客
09-24 26
本文综述了蛋白质亚细胞定位预测方法SCL pred的开发与应用，以及甘蔗转录组中渗透保护剂基因的研究进展。SCL pred基于新型神经网络架构，可高效预测动物、真菌和植物蛋白的亚细胞定位，具有良好的准确性和扩展潜力。在甘蔗研究中，通过数据挖掘识别了多种渗透保护剂相关基因，分析其保守性、表达模式及共表达关系，揭示了其在应对干旱、盐度等胁迫中的重要作用，并为作物抗逆育种提供了理论依据和基因资源。两项研究分别从蛋白质功能预测和植物胁迫响应机制角度，为生命科学研究和农业应用提供了重要支持。
Plant Cell｜澳大利亚国立大学研究团队揭示狗尾草应对长期高温的 “生存秘籍”-三重协同机制逆天改命！
Biotree_2025的博客
06-03 658
热胁迫下，参与蔗糖合成的关键酶(cFBA、cPGI、cPGM、UGP2、SPP)蛋白丰度显著增加，但其转录水平(如cFBA、cFBP、SPS)及蔗糖分解酶(SUS、INV)的基因表达却普遍下调或上调（图8），这与代谢组学显示的蔗糖、葡萄糖、果糖积累（图7）一致，表明高温通过转录后调控增强蔗糖合成与分解。研究通过测定4周龄S. viridis的叶片发现，热胁迫植株较对照组淀粉积累量显著减少（图6A），而可溶性糖（蔗糖、葡萄糖、果糖）及渗透保护物质（海藻糖、棉子糖、脯氨酸）水平大幅升高（图6B-D）。
7、甘蔗渗透保护机制的深入解析
open4的博客
09-25 27
本文深入解析了甘蔗在应对生物和非生物胁迫时的渗透保护机制，系统阐述了多种相容性渗透剂（如脯氨酸、甘氨酸甜菜碱、海藻糖、半胱氨酸及含肌醇化合物）的合成途径及相关基因的发现情况。研究基于转录组数据，揭示了P5CS、P5CR、CMO、BADH、TPS、TPP、SAT、OASTL等关键基因在甘蔗中的存在与表达模式，并通过系统发育分析展示了这些基因在进化上的保守性与功能分化。结果显示，这些基因在胁迫条件下显著表达，且部分基因呈现共表达或染色体聚集特征。文章进一步探讨了该研究成果在作物抗逆育种中的应用潜力，提出了从基因
突破！LiP-MS+TPP 解锁渗透剂维稳密码，开启蛋白质组研究全景时代
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12-03 570
在极端环境中，沙漠啮齿动物能抵御干旱，深海生物可耐受高压 —— 这些生命奇迹的背后，藏着一种名为 “渗透剂（Osmolytes）” 的 “分子盾牌”。它们是生物体应对逆境的核心武器，从早期被观察到的 “相容性保护” 现象，到如今成为生物技术领域的研究热点，渗透剂的神秘面纱正被两项关键技术逐步揭开。 今天，我们就来聊聊有限蛋白酶解质谱（LiP-MS）与热蛋白质组分析（TPP）如何颠覆渗透剂研究范式，带来从机制解析到产业应用的全链条突破。
AO3镜像使用指南[可运行源码]
01-01
本文提供了AO3作品库非官方镜像的使用指南，包括搭建个人镜像站点的步骤、访问被屏蔽内容的方法以及项目API的使用建议。用户可以通过克隆代码、准备环境、配置部署和运行服务来搭建自己的镜像站点。访问镜像站点时，建议选择推荐的镜像地址，并在遇到问题时尝试不同的站点或刷新页面。对于开发者，建议直接与项目维护团队沟通以获取API接口的详细信息。使用非官方镜像可能存在风险，用户应确保个人信息安全，并定期查看项目主页以获取最新指导。
2022年超额管理费用测算代码与数据：企业寻租代理变量Rent的构建与应用
01-01
本研究选取2001年至2022年间的上市公司数据作为初始样本，共计包含45,649个观测值。在样本筛选过程中，依据学术惯例，剔除了金融行业公司、被标记为ST或PT状态的企业、已处于资不抵债状况的公司，以及关键变量数据存在缺失的样本。 在衡量企业寻租活动强度方面，本研究借鉴了陈骏等学者于《会计研究》2021年发表的研究方法。具体而言，首先构建了管理费用率的回归模型，随后提取该模型的残差项，并将其定义为超额管理费用。该残差值被命名为Rent，并作为企业寻租程度的代理变量纳入后续分析。 本研究可提供完整的原始数据集、数据处理与分析的执行程序代码，以及最终的实证结果。结果文件将以Excel和Stata（dta）两种常用格式提供，以确保研究过程的可复现性与结果的易用性。 主要参考文献如下： 1. 陈骏, 徐捍军, 林婧华. 企业寻租如何影响审计意见购买?[J]. 会计研究, 2021. 2. 刘春奇, 王秋红, 晁峰. 超额管理费用与企业“真实”业绩:促进还是抑制[J]. 南方经济, 2017.。 资源来源于网络分享，仅用于学习交流使用，请勿用于商业，如有侵权请联系我删除！
欧姆龙触摸屏软件MPTST 5.02.zip
01-01
源码地址： https://pan.quark.cn/s/a4b39357ea24 欧姆龙触摸屏编程软件MPTST 5.02是专门为欧姆龙品牌的工业触摸屏而研发的编程解决方案，它赋予用户在直观界面上构建、修改以及排错触摸屏应用程序的能力。 该软件在工业自动化领域具有不可替代的地位，特别是在生产线监视、设备操控以及人机互动系统中发挥着核心作用。 欧姆龙MPTST（Machine Process Terminal Software Touch）5.02版本配备了多样化的功能，旨在应对不同种类的触摸屏项目要求。 以下列举了若干核心特性：1. **图形化编程**：MPTST 5.02采用图形化的编程模式，允许用户借助拖拽动作来设计屏幕布局，设定按钮、滑块、指示灯等组件，显著简化了编程流程，并提升了工作效率。 2. **兼容性**：该软件能够适配欧姆龙的多个触摸屏产品线，包括CX-One、NS系列、NJ/NX系列等，使用户可以在同一个平台上完成对不同硬件的编程任务。 3. **数据通信**：MPTST 5.02具备与PLC（可编程逻辑控制器）进行数据交互的能力，通过将触摸屏作为操作界面，实现生产数据的显示与输入，以及设备状态的监控。 4. **报警与事件管理**：软件中集成了报警和事件管理机制，可以设定多种报警标准，一旦达到预设条件，触摸屏便会展示对应的报警提示，助力操作人员迅速做出响应。 5. **模拟测试**：在设备实际连接之前，MPTST 5.02支持用户进行脱机模拟测试，以此验证程序的正确性与稳定性。 6. **项目备份与恢复**：为了防止数据遗失，MPTST 5.02提供了项目文件的备份及还原功能，对于多版本控制与团队协作具有显著价值。 7. **多语言支持**：针对全球化的应...
Java生成汉字方法-下载即用.zip
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Java编程语言提供了生成汉字字符的方法，该方法通过编写Java程序来随机产生汉字。 下载方式：https://pan.quark.cn/s/2e4f1d1330a5 这种技术能够满足特定的生成汉字需求。 背景信息--------GB 2312-80是中国官方发布的简体中文字符集标准，全称为《信息交换用汉字编码字符集·基本集》，由中国国家标准管理机构于1981年5月1日正式推行。 GB2312编码在中国大陆广泛使用，同时新加坡等地区也采纳了这一编码体系。 在中国大陆，几乎所有中文处理系统和国际化软件均支持GB 2312。 GB2312标准总共包含了6763个汉字，其中一级汉字有3755个，二级汉字为3008个；此外还收录了包括拉丁字母、希腊字母、日文平假名及片假名字母、俄语西里尔字母等在内的682个字符。 GB2312标准的制定，基本上满足了汉字在计算机中的处理需求，其所收录的汉字已经覆盖了在中国大陆99.75%的使用频率。 Java编程实现随机汉字生成的方法-----------------------------在Java编程环境中，可以利用Random类来生成随机数值，并将这些数值转换为汉字字符。 以下是一个基础的示例代码：```javaimport java.io.UnsupportedEncodingException;import java.util.Random;public class GeneCharTest { public static void main(String[] args) { for (int i = 1; i < 24; i++) { System.out.print(getRandomChar() + " "); } } privat...
双色球历史数据分享[代码]
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本文分享了从2013年1月1日至2024年2月29日的双色球历史数据，共计11年的数据，适合进行大数据分析。作者已经对数据进行了标准化处理，将6个红球和1个蓝球的数据列分割，并转化为数值类型，方便直接分析。文章还提供了数据下载的网盘链接和提取码，供彩友使用。此外，作者还提到之前分享的福彩和体彩历史数据采集器的安装使用步骤，并回应了彩友们的需求，直接提供了采集好的历史数据，省去了安装插件的环节。
基于Matlab的湍流通道流溶解过程参数化分析工具
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本资源包为流体力学与化学传质交叉领域的研究提供了一套完整的数值模拟解决方案，重点针对湍流条件下通道内溶解物质的输运与分布规律进行定量分析。该工具集专为高等院校理工科专业的教育与科研需求设计，尤其适合计算机科学、电子工程及数学等相关学科的本科生在完成课程项目、综合设计或学位论文时使用。 软件环境兼容多个版本的MatLAB平台，包括2014a、2019b及后续的2024b发行版，确保了在不同实验室或个人计算环境中的可移植性。资源包内预置了经过验证的示例数据集，用户可直接调用主程序执行计算，显著降低了初始学习成本，使初学者能够迅速掌握基本操作流程。 代码架构采用模块化与参数驱动设计。所有关键物理参数（如流速、扩散系数、边界条件等）均集中于独立的配置模块，用户无需深入底层算法即可灵活调整计算条件，从而高效模拟多种湍流溶解场景。程序逻辑结构清晰，各功能段均配有详尽的说明注释，既阐述了数值方法的理论依据，也解释了关键步骤的实现意图，便于使用者理解模型构建过程并进行针对性修改。 在学术训练方面，本工具能够帮助学生将抽象的流体动力学与传质理论转化为可视化的数值实验结果，深化对湍流混合、浓度边界层等概念的理解。对于毕业设计或专题研究，其参数化框架支持用户嵌入自定义模型，开展创新性数值实验，为深入研究复杂流动中的溶解机制提供可靠的技术支撑。 总体而言，该MATLAB分析工具集通过结构化的代码设计、完备的案例支持与广泛的版本兼容性，为流体溶解现象的数值研究提供了一个高效、可扩展的计算平台，兼具教学示范与科研探索的双重价值。 资源来源于网络分享，仅用于学习交流使用，请勿用于商业，如有侵权请联系我删除！
jspm自行车个性化改装推荐系统【附源码+数据库+万字论文+PPT+包部署+录制讲解视频】.zip
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标题JSPM自行车个性化改装推荐系统研究AI更换标题第1章引言介绍自行车个性化改装推荐系统的研究背景、意义及国内外研究现状。1.1研究背景与意义阐述自行车个性化改装需求增长及推荐系统的重要性。1.2国内外研究现状分析国内外自行车改装推荐系统的研究进展及不足。1.3研究方法及创新点概述JSPM系统的设计方法及相较于其他系统的创新点。第2章相关理论介绍与自行车个性化改装推荐系统相关的理论基础。2.1个性化推荐理论阐述个性化推荐的基本原理和常用算法。2.2自行车改装知识介绍自行车结构、部件及改装选项等基础知识。2.3用户偏好分析理论讨论如何分析用户偏好以实现精准推荐。第3章JSPM系统设计详细介绍JSPM自行车个性化改装推荐系统的设计方案。3.1系统架构设计阐述系统的整体架构、模块划分及功能。3.2数据库设计介绍系统数据库的设计思路、表结构及关系。3.3推荐算法设计详细介绍基于用户偏好的推荐算法实现过程。第4章系统实现与测试介绍JSPM系统的实现过程及测试方法。4.1系统开发环境与工具说明系统开发所使用的环境、工具及技术栈。4.2系统实现过程阐述系统从设计到实现的具体步骤和关键代码。4.3系统测试与优化介绍系统的测试方法、测试结果及优化措施。第5章研究结果与分析展示JSPM系统的实验分析结果并进行讨论。5.1实验数据与指标介绍实验所采用的数据集、评估指标及实验环境。5.2实验结果展示通过图表等形式展示实验结果，包括推荐准确率等。5.3结果分析与讨论对实验结果进行详细分析，讨论系统的优缺点及改进方向。第6章结论与展望总结JSPM自行车个性化改装推荐系统的研究成果并展望未来。6.1研究结论概括本文的主要研究成果，包括系统设计、实现及实验结果。6.2展望指出系统存在的不足，提出未来研究的方向和改进措施。
【物联网竞赛】基于ESP32的边缘AI系统设计：环境监测与智能识别应用
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内容概要：本文围绕ESP32在计算机竞赛中的实战应用，系统介绍了如何利用ESP32实现从环境监测到边缘智能的跃迁。重点讲解了基于ESP32的物联网开发核心技术，包括FreeRTOS双核任务分配、TinyML模型部署、低功耗设计、SPIFFS分区优化以及Wi-Fi与I²S外设协同工作等关键技术，并通过“考场噪声作弊检测”项目详细展示了从硬件选型、MFCC特征提取、TensorFlow Lite Micro模型推理到Wi-Fi数据上报的完整实现流程。同时提供了竞赛中常见的调试技巧与避坑经验，如JTAG调试、信道干扰应对、GPIO冲突解决等，最后展望了ESP32-S3、Matter协议和RISC-V架构在未来竞赛中的发展趋势。; 适合人群：具备嵌入式开发基础、熟悉C/C++和Arduino/ESP-IDF开发环境，参加蓝桥杯、全国大学生物联网设计竞赛或“互联网+”等赛事的高校学生及指导教师。; 使用场景及目标：①掌握ESP32在真实竞赛项目中实现边缘AI的全流程设计方法；②学习如何在资源受限设备上部署轻量级机器学习模型并优化性能；③提升在高压竞赛环境下解决硬件兼容性、通信稳定性和系统功耗等问题的能力。; 阅读建议：建议结合GitHub开源项目esp32-cheat-detector进行代码实践，重点关注双核调度、MFCC计算优化与模型集成部分，同时模拟竞赛场景测试系统的稳定性与鲁棒性。
编译原理实验，C++编写NFA确定化和最小化程序
01-01
下载前必看：https://pan.quark.cn/s/a4b39357ea24 在计算机科学范畴内，编译原理被视为一个关键分支，它主要探讨编程语言如何转化为机器可识别的形式。 本次实验的核心内容是关于非确定有限自动机（NFA）的确定化与最小化这两个重要过程，这两个概念对于深入理解正则表达式以及编译器设计具有决定性意义。 我们将详细研究NFA，并分析其确定化、最小化的相关理论及在C++中的具体实现。 非确定有限自动机（Non-Deterministic Finite Automaton，简称NFA）是一种用于识别正则语言的计算模型。 与确定有限自动机（DFA）相比较，NFA在处理输入信号时能够存在多个状态转移路径。 在NFA的结构中，一个状态对于相同的字符输入可以产生多个不同的输出，这一特性使得NFA在某些应用场景下更为强大，能够识别更为复杂的正则表达式。 将NFA进行确定化，指的是将其转化为一个等价的DFA。 在确定的DFA中，当处理输入信号时，只有一个明确的路径可供选择，这种结构对于实际操作来说更为高效。 确定化NFA的过程通常涉及到ε-闭包（epsilon closure）的概念，即针对一个状态集合，找出所有可以通过ε（空字符）从该集合中的任一状态移动到达的状态集合。 通过逐步构建状态转移表，我们可以逐步形成等价的DFA。 NFA的最小化过程是指找到一个与原始NFA等价但状态数量最少的DFA。 最小化DFA的主要目的在于减少内存的使用量并提升执行效率。 常用的最小化方法是基于子集构造法，通过对比每个状态集合的特性（例如是否接受或拒绝特定的输入信号），逐步合并相似的状态集合，直到无法继续合并为止。 C++作为一种功能强大的系统级编程语言，提供了丰富的数据结构与算法支持，非常适合用...
ProgramReading.cpp
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ProgramReading.cpp
Walmart-Forecasting: 线性回归，ETS模型，ARIMA模型和动态回归模型预测五年每日单位销售数据
01-01
下载前可以先看下教程 https://pan.quark.cn/s/a4b39357ea24 沃尔玛产品部门销售的时间序列分析与预测项目概述中，我们团队基于Walmart提供的五年单位销售数据，针对特定产品（FOODS_3_352）运用四种模型进行了为期28天的单位销售预测。 首先，我们实施了基础的数据清洗流程以及数据可视化操作，并对销售规律进行了深入探究。 接着，我们运用了回归分析模型，ETS（误差，趋势，季节性）模型，季节性ARIMA（自回归，积分，移动平均值）模型以及动态回归模型来对数据进行细致分解并展开预测工作。 最终，我们借助参数RMSE对预测模型的效能进行了衡量。 所有项目相关文档均存放在此代码仓库中。 所使用的工具/语言包括： Python(pandas, numpy) ， R(forecast, ggplot, dbplyr, urca, lubricate) ， Excel 请参考我们的最终文件说明1. data calendar_factors.csv文件中包含了经过处理并准备好的日历虚拟变量数据
【物联网竞赛】基于ESP32与BLE Mesh的无网区应急救援定位系统：低功耗自组网与三维可视化关键技术研究
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内容概要：本文介绍了一个基于ESP32和BLE Mesh技术的“无网区”应急救援定位系统，适用于断网、断电等极端环境下的人员定位与生命体征监测。系统利用ESP32实现自组网通信，通过BLE Mesh网络泛洪优化、RSSI三角测量与粒子滤波算法实现0.8米精确定位，并集成ESP-NOW双模冗余传输保障数据可靠。系统支持WebBluetooth直连查看、Three.js构建3D可视化大屏及VR沉浸式展示，具备低功耗特性（平均800µA），配合太阳能可长期运行。代码层面展示了可穿戴节点与汇聚网关的核心实现，涵盖数据封装、多通道传输、JSON上云与WebSocket实时推送，满足计算机竞赛中高鲁棒性、高可视化的评审要求。; 适合人群：具备嵌入式开发基础、物联网或计算机相关专业、参与大学生计算机类竞赛（如物联网赛道、红旅赛道）的学生团队及指导教师；有一定C++/Arduino编程经验的研发人员。; 使用场景及目标：①应用于地震废墟、雪崩救援、偏远地区走失定位等无公网场景的应急系统设计；②作为全国大学生计算机竞赛中的高分项目模板，突出技术创新、稳定性与现场表现力；③学习BLE Mesh自组网、低功耗设计、多模通信冗余、三维可视化等关键技术实现。; 阅读建议：此资源紧密结合竞赛实际需求，建议读者深入理解代码结构与通信机制，重点掌握BLE Mesh与ESP-NOW协同策略、定位算法优化及数据可视化链路搭建，并结合硬件实测进行调试与性能验证，全面提升项目落地能力与答辩竞争力。
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