lammps在win10子系统（Ubuntu）下的简易安装

最新推荐文章于 2024-09-14 09:42:33 发布

Jasonkun_3

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文章标签： linux ubuntu windows 经验分享 lammps

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/Jasonkun_3/article/details/105233074

版权

更正内容：
20.04版本
在使用官方源的情况下，采用官方安装教程。
注意，若更改软件源，可能导致安装失败。
python-virtualenv 会提示安装失败，可忽略，不安装此软件。

位于安装包目录下

cd /src

make package-status	#查看各模块是否启用或关闭
make yes-Module-name	#开启 Module-name此模块
make no-Module-name	#关闭 Module-name此模块

在这里插入图片描述

重新编译前一定需要执行

make clean-all  # 清理上次编译文件

以下内容为旧版，仅参考！
—————————————————————————————————————————————

我是一名初学者，有不对的地方，请大家多多指教。

我看过很多安装教程，搜索引擎上面一搜索就让我们眼花缭乱。作为一位linux的小白，我们必须自立更生！

其实大多数的教程都是把lammps官网的安装教程翻译成了中文，当然，作为一名小白，我也不会例外，毕竟还是要相信官方。凡是从简到繁，从易到难，这是目前最简单的安装方法（不包括编译，我还没学会编译!）。

接下来是lammps官方提供的专用于win10子系统Ubuntu下的安装教程，同理其实应该适用于所有Ubuntu系统。

一、在win10中安装Ubuntu

win10的子系统只能在某些版本中开启，具体请另行查询。此建议专业版，不建议家庭版。
启用开发者模式
通过首先打开Windows设置并启用开发人员模式来启用此功能。转到Windows设置并搜索“开发人员”。这将允许您安装Windows Store外部的软件，需要重启电脑。
在这里插入图片描述
安装适用于Linux的Windows子系统
同样，在“设置”对话框中搜索“启用或关闭Windows功能”。这将打开一个对话框，其中列出了可以安装的功能。在“适用于Linux的Windows子系统”上添加一个选中标记，然后按确定。
在这里插入图片描述
为Windows安装Bash
安装完成后，在Microsoft Store中搜索“ Ubuntu”。选择找到的选项。下载并安装。

安装完成后，在开始菜单中找到以下图标，并单击打开。

出现一个命令行窗口，请按提示进行设置账号和密码操作，Ubuntu安装成功！

二、更新Ubuntu软件源

1、备份

sudo cp /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources.list.bk

2、编辑

sudo vim /etc/apt/sources.list #vim使用方法请自行百度

请注释掉其他地址（在没加#号的所有地址前加#号）
在文档最后添加一下源地址（复制粘贴即可）
建议使用阿里源，其他源请自行百度

deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiverse
deb http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-security main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-updates main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-proposed main restricted universe multiverse
deb-src http://mirrors.aliyun.com/ubuntu/ bionic-backports main restricted universe multiverse

保存并退出
3、执行命令

sudo apt-get update
sudo apt-get -f install
sudo apt-get upgrade
sudo apt-get dist-upgrade

三、使用ssh连接Ubuntu

安装 ssh-server

sudo apt install openssh-server

修改 ssh-server 配置

cp /etc/ssh/sshd_config /etc/ssh/sshd_config.bak
sudo vim /etc/ssh/sshd_config

需要修改以下几项：

Port 2222 # 默认的是22，但是windows有自己的ssh服务，也是端口22，防止端口占用
ListenAddress 0.0.0.0 
LoginGraceTime 120 
PermitRootLogin yes 
StrictModes yes 
PubkeyAuthentication no # 是否允许公钥认证，默认值为"yes"，修改为no 
PasswordAuthentication yes #是否允许使用基于密码的认证。修改为yes 
RSAAuthentication no # 是否允许使用纯RSA公钥认证，默认值为"yes"修改为no

这里需要仔细更改，bash页面颜色不易分辨。

启动 ssh server

sudo service ssh restart #如果提示sshd error: could not load host key，则用下面的命令重新生成 
dpkg-reconfigure openssh-server #执行上述命令后,会有提示选择,直接按Enter即可

查看IP地址

ifconfig

6.设置开机启动ssh服务:
此时还不完善,因为ubuntu是windows子系统,子系统的开机并没有自启动ssh的功能.需要利用脚本去实现.
配置ubuntu的脚本
#创建init.wsl文件,保存并保存.注意#! /bin/sh这行不是注释,是sh解释器的指定方式.以下三行:第一行为创建文件,二三两行是编写的内容

vim /etc/init.wsl

#! /bin/sh 
/etc/init.d/ssh $1

添加执行权限

chmod +x /etc/init.wsl

编辑sudoers，避免输入密码

vim /etc/sudoers #添加以下这行到该文件
%sudo ALL=NOPASSWD:/etc/init.wsl

配置windos脚本
先在运行>命令(win+r)中输入shell:startup打开启动文件夹

再在该文件夹中创建文件ubuntu1804.vbs
将以下内容写入该文件并保存

Set ws = CreateObject("Wscript.Shell")
ws.run "ubuntu run sudo /etc/init.wsl start", vbhide

7.以后开机就可以利用远程操作软件直接连接刚才配置的127.0.0.1的子系统了
建议使用winscp和putty，无广告嫌疑，只因为免费！

注意
如果winscp提示传输文件没有权限：

首先设置 root 密码

sudo passwd root
[sudo] password for luban:        //输入当前普通用户的密码
Enter new UNIX password:          //给root设置密码
Retype new UNIX password:         //确认输入密码
passwd: password updated successfully

启动 ssh server

sudo service ssh restart

四、安装lammps

可以作为Debian软件包下载适合在最新的Ubuntu Linux版本上运行的预构建的LAMMPS可执行文件。这使您可以使用单个命令来安装LAMMPS，并通过简单地更新操作系统来保持最新版本的LAMMPS。

要安装适当的个人软件包归档文件（PPA），请执行一次以下操作：

由于网络原因可能会提示失败，请反复尝试，楼主在安装时，基本需要下载5次以上，请不要放弃

sudo add-apt-repository ppa:gladky-anton/lammps
sudo apt-get update

要安装LAMMPS，请执行以下操作一次：

$ sudo apt-get install lammps-daily

这会将名为“ lmp_daily”的可执行文件下载到您的系统中，然后可以在具有in文件的文件夹输入脚本：
注意in文件名

$ lmp_daily -in in.lj

要将LAMMPS更新到最新版本，请执行以下操作：

$ sudo apt-get update

这也将更新系统上的其他软件包。

本文综合了win10子系统Ubuntu的安装及简单设置，同时引用了lammps官网的安装教程。

欢迎批评指正！