引言
本博客书接上文:ABIDE Preprocessed 结构态MRI数据集介绍及下载,写前一篇的时候因为觉得FreeSurfer流程处理完成的数据过于庞杂,想要从中获得需要的ROI层面形态学特征过于复杂,所以只是简单说明了其下载方式,并未对其所包含的内容进行介绍。本篇作为前一篇的补充,介绍了输出文件较为重要的几项,以及如何从中获取脑区的形态学特征。
数据类型
可下载的处理完成结构态MRI数据参见FreeSurfer Output,其中较为重要的两个子文件夹为label及surf,前者包含了大脑顶点的脑区标注,后者则是这些顶点的形态学特征。在不同的脑图谱下,同一个大脑顶点可能会划分至不同的脑区,同时大脑皮层本身也会被划分成不同数目的区域,也因此在label文件夹下包含了不同的parcellation文件。同理,依据平滑度以及所提形态学特征的不同,surf文件夹下也包含了对顶点的不同描述。
分区label文件
首先来看label文件夹,主要是包含了3种脑区划分:
- BrodmannAreaMaps,对应文件(以左半脑为例):lh.BA.
ABIDE结构态MRI数据输出文件介绍

本博客是ABIDE Preprocessed结构态MRI数据集介绍的补充,介绍了输出文件中重要的分区label文件和形态学特征surf文件,包括其包含内容、读取方式等,还提及数据下载脚本需修改,可用Python打开数据,有需要可私信或留言。
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