ABIDE Preprocessed 结构态MRI数据集介绍及下载

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#python #人工智能 #健康医疗

ABIDE数据集介绍及下载

 ABIDE Prerocessed项目是在ABIDE I 项目的基础上发展而来，主要是对ABIDE I中采集到的原始数据进行了一定的预处理和初步的特征提取。针对于fMRI和sMRI数据有着不同的处理方式，本次主要对其中提供的sMRI预处理结果进行介绍，同时对这些数据的下载方法进行展示。除此之外，采集策略、样本数目等更为宽泛的介绍参见官网ABIDE Preprocessed

 首先ABIDE Preprocessed项目对于sMRI数据给出了三种不同的预处理方案下的结果，分别为ANTS、CIVET、FreeSurfer，不同方案下的脑区分割策略以及获得的特征都存在着些许差异，由于笔者比较关注于Region based的特征，因此对于其中Vertex based的特征并未进行细致的了解，相应的，没有给出明确region based结果的Free surfer方案将着墨不多。以下进行详细介绍。

ANTS

 ANTS方案下提供了两种sMRI特征，一种是voxel-wise的皮层厚度特征；一种是region-based平均皮层厚度特征，采用的大脑皮层分区方式为DKT模版，但原本的35个区域从中去除了4个区域bankstss、corpus callosum、 frontal pole、 temporal pole，因此最终在大脑皮层层面左右半均只有31个ROIs。此外，下载得到的数据中还包含了非皮层区域的厚度特征，具体可以参见官网给出的number-name对应：labeling protocol
 数据的下载链接模版为：
https://s3.amazonaws.com/fcp-i

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