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原创 Linux环境下向github上传代码(生成token、生成本地密钥)
(一)准备工作1、在github上创建新仓库这步很简单登录github,在右上角的加号下面选择:New repository在新出现的页面里输入新仓库的名字,设置权限,是否创建readme文件等即可。2、生成token自从2021年8月31日开始,github不支持登录密码上传,需要使用token。登录后右上角下拉框点“Setting”(倒数第二个)在出现的页面中选择Developer settings再点击personal access tokens 即可进行个人token的设置。
2021-11-06 19:30:23
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原创 pytorch系列(三)——cuda下DGL库安装
1、不限制DGL安装版本时进入DGL官网根据cuda版本选择对应的命令复制Run this 后面这句话:conda install -c dglteam dgl-cuda10.2 到终端,按下回车等待出现是否同意继续,输入y。写文章时是默认自动安装0.7.1版本。若有指定DGL版本的需求,请看2内容。2、指定DGL版本若已经安装了不需要的DGL版本,比如0.7.1想替换为0.4.3版本,则要删除现有版本:默认删除当前DGL:conda uninstall -c dglteam dgl-cu
2021-10-14 14:34:22
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原创 pytorch系列(二)Linux下安装pytorch
Anaconda下pytorch环境安装(Linux)本文默认已经安装了anaconda,如未安装可参考:pytorch系列(二)Linux下安装anaconda(还没写,更新之后再加链接,小伙伴们先查看其他anaconda教程吧!)1、创建新的pytorch虚拟环境根据自己的python版本在终端输入如下命令,将新环境命名为:pytorch(你喜欢的任意名字均可)conda create -n pytorch python=3.7显示内容如下, proceed的那行输入:y2、进入新创建的
2021-07-06 19:59:58
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原创 医学图像处理(三)ABIDE数据集下载
ABIDE数据集下载ABIDE 自闭症数据集 提供了经过预处理的FMRI时时序数据(也有图像数据吧,因为我用的时序,图像数据没有下载看过哦),本文记录两种ABIDE数据下载方法。(个人认为i方法二更方便好用,但如果安装不明白nilearn,就使用方法1)ABIDE数据集网址百度搜索ABIDE或直接点击链接进入方法一:github脚本下载(不需安装nilearn)官网提供的github链接download_abide_preproc_guide.txt中给出了具体的下载方法,和可供选择的参数。
2021-01-27 12:19:16
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原创 pytorch系列(一)常见错误
pytorch使用(一)常见错误1、RuntimeError: scatter_(): Expected dtype int64 for index.RuntimeError: scatter_(): Expected dtype int64 for index.scatter要求数据是int64类型,而我在定义tensor时写的是torch.Tensor(x),应该写成torch.LongTensor(x),指定为int64类型。其他数据类型的定义方法可参考:https://pytorch.or
2021-01-26 16:13:04
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原创 医学图像处理(二)Python rawb数据读取、转换nii
最近使用Brainweb时第一次遇见rawb格式的脑数据,本文总结rawb数据的python读取方法,以及将rawb数据转换成nii数据,方便用itk snap等软件查看Brainweb的数据包括灰质白质等标签,下载方便。链接:https://brainweb.bic.mni.mcgill.ca/brainweb/Python读rawb...
2020-04-08 19:55:20
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原创 Latex(CTex)常见错误
Latex(CTex)常见错误1、Latex File “elsarticle.cls” not found缺少elsarticle.cls这个文件,在网上下载后跟tex文件放在一个文件夹下,再运行就不会报这个错误了。下载地址:https://www.elsevier.com/authors/author-schemas/latex-instructions(一共需要下载elsarticl...
2020-02-27 14:05:40
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原创 医学图像处理(一)dicom数据转换为nii
最近开始接触医学图像处理,是小白中的小白,总结一些我遇到的坎和解决方法,帮助更我一样“负基础”的同学们~撰写的内容均是小白我自己的理解,有错误还请大家多多指正!dicom数据转换为nii可以用SPM12自带的DICOMImport转换,也可以使用MRIConvert软件转换。【SPM】图片左边是SPM的操作框,选择其中的DICOMImport即可以跳出右边的界面,可选择要转换的DICOM...
2019-12-12 22:30:57
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空空如也
空空如也
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