[分子指纹]关于smile结构的理解

DJ.马

已于 2024-11-15 22:41:01 修改

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分类专栏：人工智能药物设计 # 分子指纹文章标签： smiles

于 2024-02-27 03:47:13 首次发布

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/DJJ5210/article/details/136312102

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文章描述了一个关于化学结构中的奇异现象，作者在Q2结构中观察到，在多糖位置添加[C@H]时，仅增加了一个氢原子(H)，而非预期的碳原子(C)，这在Q1和其他结构中未见。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

我的案例中有个奇怪的现象，我发现。

比如我有几个结构

Q1：C1C(=O)C(C2C(C1)(C1C(CC2)(C2(C(=CC1)C1C(CC2)(CCC(C1)(C)C)C(=O)O)C)C)C)(C)C
Q2：C1C(C(C2C(C1)(C1C(CC2)(C2(C(=CC1)C1C(CC2)(CCC(C1)(C)C)C(=O)O)C)C)C)(C)C)O

T2：O(C1C(C2C(C3C(C4(C(=CC3)C3C(CC4)(CCC(C3)(C)C)C(=O)O)C)(CC2)C)(CC1)C)(C)C)C1OC(C(O)C(O)C1O)C(=O)O


Q2的结构最后面后面加个[C@@H]，只会加个H，不会加C，注：是多糖的位置

Q1：C1C(=O)C(C2C(C1)(C3C(CC2)(C4(C(=CC3)C5C(CC4)(CCC(C5)(C)C)C(=O)O)C)C)C)(C)C

Q2:C1C(C(C2C(C1)(C3C(CC2)(C4(C(=CC3)C5C(CC4)(CCC(C5)(C)C)C(=O)O)C)C)C)(C)C)O

Q2改：C1C(C(C2C(C1)(C3C(CC2)(C4(C(=CC3)C5C(CC4)(CCC(C5)(C)C)C(=O)O)C)C)C)(C)C)O[C@@H]

Q2图