
分子指纹
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指纹性质和使用
DJ.马
生物与医药研究员
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PaDEL配置和使用
PaDELPy 是一个用于计算分子描述符和指纹的 Python 包装器,它允许用户通过 Python 直接访问 PaDEL-Descriptor 软件的命令行接口。PaDEL-Descriptor 是一个广泛使用的分子描述符计算工具,而 PaDELPy 则简化了在 Python 环境中使用该工具的过程。安装 Java Runtime Environment (JRE): 由于 PaDEL-Descriptor 是基于 Java 的,因此需要安装 JRE 6 或更高版本。原创 2024-11-15 22:46:57 · 782 阅读 · 0 评论 -
【分子指纹】化学分子指纹的概念和应用(非常重要)
分子指纹(Molecular fingerprints)可以低计算成本的方式表示大规模化学数据集中化合物的化学(结构、物理化学等)性质。它们在将化学数据集中的分子转换为适合于计算方法的一致输入格式(bit向量或数值)方面发挥着重要作用。在这篇综述中,原创 2023-11-23 01:23:20 · 9535 阅读 · 0 评论 -
[分子指纹]关于smile结构的理解
Q2改:C1C(C(C2C(C1)(C3C(CC2)(C4(C(=CC3)C5C(CC4)(CCC(C5)(C)C)C(=O)O)C)C)C)(C)C)O[C@@H]我的案例中有个奇怪的现象,我发现。原创 2024-02-27 03:47:13 · 368 阅读 · 0 评论