LAMMPS与MATLAB之间的速度自关联函数比较

LAMMPS与MATLAB之间的速度自关联函数比较

引言：
速度自关联函数是一个在分子动力学模拟和材料建模中广泛使用的工具，用于分析材料中原子或分子速度的自相关性。在本文中，我们将比较两种常用的工具：LAMMPS和MATLAB，在计算速度自关联函数方面的功能和性能差异。我们将提供相关的源代码示例，并讨论它们的使用方法和适用范围。

LAMMPS：
LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一个开源的分子动力学模拟软件包，用于模拟原子、分子和大尺度粒子系统的动力学行为。LAMMPS提供了丰富的功能和灵活的输入选项，包括计算速度自关联函数。

以下是使用LAMMPS计算速度自关联函数的示例代码：

# LAMMPS input script for velocity autocorrelation function (VACF) calculation

# Set up the simulation
dimension 3
boundary p p p
units lj
atom_style atomic

# Create atoms
lattice fcc 0.8442
region box block 0 10 0 10 0 10
create_box 1 box
create_atoms 1 box
mass 1 1.0

# Define interactions
pair_style lj/cut 2.5
p