Running MaxQuant——蛋白质组学建库软件（一）

最新推荐文章于 2025-11-13 14:05:16 发布
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#生物信息学 #蛋白质组学 #建库

本教程介绍了如何使用MaxQuant进行蛋白质组学建库。首先打开软件界面，如果已有参数可导入；接着在“原始数据”部分加载.raw文件，选择样本类型。在“组特定参数”中设置修饰和仪器类型；在“全局参数”中导入.fasta文件并调整标识符选项。最后点击“开始”运行分析。

1. 打开MaxQuant界面

在这里插入图片描述

2. 如果有之前设置好的参数，可以直接点击“文件”选择“加载参数”导入。没有则跳过。

3. “原始数据”：

“Load”：将.raw文件直接导入软件，根据样本选择“No fractions”或者”Set fractions”。
在这里插入图片描述

4. “组特定参数”：

“Modifications”：选择样本相关的修饰，点击“<”添加或删除。
在这里插入图片描述
“Instrument”：MaxQuant会自动选择机器类型，也可以手动修改，参数选择软件默认的即可。
在这里插入图片描述

5. “全局参数”：

“Add”：导入.fasta文件，点击“Identifier”，选择“Up to first space”。参数根据需要修改。
在这里插入图片描述

6. 点击“开始”即可开始运行。

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