【生信分析】微阵列基因芯片数据分析的一般流程

微阵列基因芯片用于大规模基因表达分析,通过杂交原理检测DNA序列。数据分析流程包括质量控制、差异表达分析、富集分析等。常见应用有基因表达谱、miRNA分析等。KEGG数据库是解析基因功能和通路的重要工具,常用于差异表达基因的通路富集分析。

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微阵列基因芯片数据

基因芯片,又叫做DNA微阵列基因芯片,为后基因组学提供了一种高通量和系统性的研究手段。它借用了计算机芯片的集成化特点,运用微缩技术,在一块数平方公分面积的特殊玻璃片或硅芯片布放数千或数万个核酸探针,形成微型的检测器件,将待检测样本标记后同芯片进行杂交,检体中的DNA、cDNA或RNA与探针结合后,借由荧光或电流等方式侦测,即可提供大量基因序列信息。研究人员应用基因芯片可以在同一时间定量分析大量(成千上万)的基因表达,具有快速、精确、低成本的检验能力,是基因组学和遗传学研究常用的工具。
基因芯片
微阵列芯片的主要优势在于它可以同时大规模,全面地检测成千上万个基因的表达。 例如,通过基因微阵列,可以在短时间内发现可能受疾病影响的基因,并且作为早期诊断的生物标记。

其原理是将两条DNA链之间杂交,互补的核苷酸碱基之间配对形成氢键

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