批量dicom格式转nii（dcm2nii），目前网上最全总结与最强转换方法！！

文章目录

• Dcm2nii各方法目前存在的问题
• 又快又稳定的批处理方法！
• 总结

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Dcm2nii各方法目前存在的问题

1. 使用mricron的dcm2niigui.exe转换，此方法虽然可以成功转换，但存在的问题如下：①输出的nii可能不止一个；②只能输出到同级目录，不能自定义输出文件深度。
2. 使用matlab中的spm12软件转换，代码如下：

matlabbatch{1}.spm.util.import.dicom.data = data_subdir3 ;
matlabbatch{1}.spm.util.import.dicom.outdir = {data_dir2} ;
spm_jobman('run', matlabbatch) ;

存在的问题是：单个病人work，多个病人循环处理经常会出现保存错乱的情况。
3. 使用python代码进行转换，代码如下：

series_file_names = sitk.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesFileNames(path)
series_reader = sitk.ImageSeriesReader()
series_reader.SetFileNames(series_file_names)
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