【Linux版本】Blast工具安装

最新推荐文章于 2025-02-25 22:03:28 发布
原创 最新推荐文章于 2025-02-25 22:03:28 发布 · 2.1k 阅读 · 17 ·
CC 4.0 BY-SA版权
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
文章标签：

#linux

本文详细指导如何从NCBI下载并安装预编译的BLAST+ 2.2.30 Linux版本，包括解压、移动、环境变量配置和验证步骤，适合Linux用户参考。

  下载文件路径：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
  选择预编译的linux版本

下载命令

wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux
最低0.47元/天 解锁文章
blast在linux上的用法
hac_kill_you的博客
11-29 9309
blast blast包含核酸序列比对，蛋白序列比对等。 主要有两个步骤： 建库 （makeblastdb） 比对 （blast） mdkebalstdb和blast的参数 makeblastdb -in input_file -input_type type #输入的文件类型：String, `asn1_bin', `asn1_txt', `blastdb', `fasta' -dbtype molecule_type #要生成的数据库类型：String, `nucl', `prot' -tit
BLAST 本地安装教程
09-26
BLAST 本地安装教程 windows 本地安装 BLAST
linux系统下 blast,Linux下BLAST安装及BLAST使用
weixin_39633781的博客
05-09 1677
1、把BLAST的压缩文件解压，然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下；2、制作软链接，将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下，eg：ln-s /home/username/blast/bin；3、在当前用户目录下，编辑bashrc文件，在文件中加入exportPATH=/home/username/bin/=$PATH;4、在当前目录下，将数据文件格...
在linux中利用conda安装blast
最新发布
hgz2020的博客
02-25 1804
conda
Linux安装使用blast
weixin_44945126的博客
12-17 2558
参考网页 1.下载blast版本 balst下载界面 2.解压安装 tar -zxvf ncbi-blast-2.11.0+-x64-linux.tar.gz #解压文件 mv ncbi-blast-2.11.0+ blast #重命名压缩文件为blast echo "PATH=$PATH:~/刚刚传输的路径/blast/bin" >> ~/.bashrc echo "PATH=$PATH:~/home/19mxynenu/blast/bin" >> ~/.bashrc #配置环
精选资源
blast-2.2.26-x64-linux
06-23
标题中的"blast-2.2.26-x64-linux"表明这是BLAST的一个特定版本，版本号为2.2.26，专为64位Linux操作系统设计。 **二、BLAST工作原理** BLAST的核心算法基于Smith-Waterman全局比对算法的简化版，它通过查找局部...
精选资源
blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz
02-02
标题中的"blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz"是一个针对64位Linux操作系统的软件包，名为BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）的版本2.2.26。BLAST是一款生物信息学工具，主要用于比较和搜索核酸或蛋白质序列，...
精选资源
ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz
04-21
三、BLAST工具的使用 1. blastn：适用于核苷酸序列比对，常用于DNA-DNA比较，查找同源基因或遗传区域。 2. blastp：用于蛋白质序列比对，查找同源蛋白质。 3. blastx：将DNA序列翻译成所有六个开放阅读框，然后与...
Linux下BLAST安装及BLAST使用
07-27
如果成功安装，将显示BLAST软件的版本信息。 现在您已经成功安装了BLAST。您可以使用各种BLAST命令（如blastn、blastp等）来执行不同类型的序列比对和搜索操作。请参考BLAST官方文档以了解更多关于使用BLAST的详细...
Linux 系统安装 NCBI Blast + A Quick Guide
生信学习
01-06 1548
NCBI BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是由美国国家生物技术信息中心（NCBI）开发的一个深受生物信息学研究者青睐的基因序列比对工具。作为生物序列信息比对的行业标准，BLAST可用于分析核酸（DNA和RNA）以及蛋白质序列。本工具的核心功能是识别给定序列（查询序列）与数据库中最相似的序列，因此在基因注释、功能预测和分子进化研究中具有不可替代的作用。blastp：用于蛋白质序列与蛋白质数据库的比对。
Linux上部署和使用Blast序列比对工具
m0_46468289的博客
12-07 5588
第一步:Index of /blast/executables/blast+/LATESThttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/去这个网址,下载ncbi-blast-2.13.0+-x64-linux.tar.gz,也就是Linux版本第二步:在linux上创建好文件夹,比如我在/home下创建soft文件夹,用于安装Blast软件.第三步:把下载好的压缩包,放到文件夹下,进行解压,命令如:tar -zxvf ncbi-bl
linux系统下 blast,Linux安装blast+及使用
weixin_33223705的博客
05-09 965
下载解压网址：选择预编译的linux版本ncbi-blast-2.10.1+-x64-linux.tar.gz可以用wget ；或者下载后上传服务器解压tar -zxvf ncbi-blast-2.10.1+-x64-linux.tar.gz解压后的文件名是ncbi-blast-2.10.1+ blast+我把它修改成了 blast+绝对路径/home/user024/blast+添加环境变量将B...
blast的快速安装使用-简易版
weixin_44874487的博客
09-06 1186
在有conda的基础上，快速使用blast，blast有时候就是神，救场yyds。
blast安装及简单使用
热门推荐
qq_35716085的博客
12-20 2万+
下载blast# 解压blast压缩包# 测试这里就代表安装成功了，但是执行命令就有点麻烦需要用全路径的blastp运行，如果想直接用blastp还需要安装另一个插件：这样安装成功之后才可以使用blastp命令。
Centos6.5系统下本地安装BLAST步骤
飘羽的博客
12-05 2818
1.NCBI上下载BLAST软件安装包： ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 2.将压缩包放在自己指定的目录下，进行解压缩： tar -zxvf ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 3.解压完成后，配置环境变量： vi /etc/profile 添加内容： export BLAST_HOME=/h
BLAST
alnx37271的博客
11-15 339
一、 准备工作： 1.1 系统平台：这里使用的是Ubuntu Linux 12.04 LTS 64bit 版本； 1.2 Windows版本： 如果你说只有Windows，安装个虚拟机嘛 推荐VirtualBox https://www.virtualbox.org/ 网上有相当多的图文教程 比如：http://blog.youkuaiyun.com/tangyajun_168/art...
linux运行blast,Linux下BLAST的使用
weixin_34432821的博客
04-30 2165
1、把BLAST的压缩文件解压，然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下；2、制作软链接，将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下，eg：ln -s/home/username/blast/bin；3、在当前用户目录下，编辑bashrc文件，在文件中加入exportPATH=/home/username/bin/=$PATH;4、在当前目录下，将数据文件格...
本地blast安装使用教程
精通多种编程语言Hello World的编写
11-08 1万+
本地blast使用教程 一、 软件安装 1.下载地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.11.0/ 2.点击红框里的版本开始下载： 3.安装步骤： 查看是否安装成功（可以不操作，直接跳到到配置环境变量）： ① 找到自己安装的文件夹 ② 将上图红框的位置改为cmd，然后回车进入命令提示符 ③ 在命令提示符输入blastn –version，然后回车 回车之后显示下图则证明安装成功 二、 配置环境变量 如图所示建立
NCBI BLAST 2.12.0+ Linux版本发布
用户解压后，可以根据文件夹中的安装说明进行软件的安装和配置，安装完毕后即可在命令行中使用BLAST工具进行序列分析。 为了正确安装和使用BLAST，用户可能需要对Linux操作系统有一定的了解，包括对命令行的基本...
评论 1
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
红包 添加红包
表情包 插入表情
表情包 代码片
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值