【生信数据预处理】第1讲：酵母RNA-Seq数据

数据集一 酵母 RNA_Seq 数据

在生物信息学研究中，酵母(Yeast, Saccharomyces cerevisiae)基因表达数据经常被用来验证理论模型、算法的应用效果。本文介绍的yeast表达数据集来自 Expression Atlas 的 E-MTAB-5174 实验。在获得了全部基因的RNA-seq的原始读数(raw-counts)后， 我们删除了零表达方差的基因。即，这些基因的表达读数几乎是常数值。经过处理后的yeast基因表达数据集由6930个基因在209个样本的RNA-seq读数值组成。

数据集二 豌豆根瘤菌 Microarray 数据

豌豆根瘤菌(R. leguminosarum) 微阵列数据来自18个不同的生长条件，每个条件有3个独立的样本，这样就获得了$n=54$