R语言【GIFT】——GIFT_traits_raw()：原始性状值

Package GIFT version 1.3.2

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Description

检索GIFT中参考书目和非标准化物种名称级别的非聚合性状值。

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Usage

GIFT_traits_raw(
  trait_IDs = "",
  derived = TRUE,
  bias_ref = TRUE,
  bias_deriv = TRUE,
  api = "https://gift.uni-goettingen.de/api/extended/",
  GIFT_version = "latest"
)

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Arguments

参数【trait_IDs】：一个字符串，指示要检索的特征。性状必须属于可用性状列表。看到GIFT_traits_meta()。

参数【derived】：包括逻辑派生的特征。

参数【bias_ref】：当为FALSE时，排除仅基于可能引入偏见的资源的条目(例如，仅包含树的资源)。

参数【bias_deriv】：当为FALSE时，排除仅基于可能引入偏见的衍生的条目(例如，所有显生植物都是木质的，但一些生命形式是模糊的)。

参数【api】：定义从哪个API检索数据的字符串。

参数【GIFT_version】：定义要使用的GIFT数据库版本的字符串。该函数默认检索最新的稳定版本。如果设置为测试版，则使用最新的版本，该版本仍然可以进行更改和编辑。

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Details

以下是每一栏的详细信息：

trait_derived_ID：数据库中性状记录的识别号

ref_ID：参考文献的识别号

orig_ID：物种的识别号，因为它来自于来源

trait_ID：性状的识别号

trait_value：性状的值(编码为性状，即使是连续性状)

derived：性状值是否来自其他信息(例如，显生植物是木质的)?

bias_deriv：这个推导是否有可能引入偏差

bias_ref：资源是否可能引入偏见

name_ID：解决前的物种识别号

cf_genus：是否属名不确定

genus：属

cf_species：是否该物种的绰号是不确定的

aff_species：物种的绰号不确定

species_epithet：种加词

subtaxon：Sub-taxon名字

author：描述这个物种的作者

matched：物种名称在分类主干中是否匹配

epithetscore：对昵称的匹配得分

overallscore：整体匹配得分

resolved：物种名称在分类学主干中被解析了吗

service：用于分类协调的分类主干

work_ID：分类上一致的物种的识别号

genus_ID：分类上统一属的识别号

work_genus：属名(经分类协调后)

work_species：物种名称(经分类协调后)

work_author：描述该物种的作者姓名

geo_entity_ref：引用所在区域的名称

ref_long：引用全文

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Value

有28列的数据框架。

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Example

succulence <- GIFT_traits_raw(trait_IDs = c("4.10.1"))