heatmap绘制热图时出现样本列名顺序调换怎么办？

最新推荐文章于 2023-07-04 18:30:26 发布
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分类专栏： R学习 生信 转录组 文章标签： 聚类
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今天像往常一样，用R中的 heatmap 包画热图，本来输入是正常的
如图，W14_1在左，W14_2, W14_3在右 本来预想的是按照我的表格顺序出图，可出来的图不是这样的

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
但是画出来，竟然是这样的？！ 样本列名顺序不一致啦！ 可以明显看到样本W14_1在中间，W14_2在右, W14_3在中间，妈耶，蒙了，试了好几种方法都是报错，后来我发现原来就是简写的问题。本想这把列去掉就可以，结果生信小白又跳进了坑，哈哈哈哈。此处踩坑三个小时。。。。。。

查看了一下Heatmap函数的参数，才知道原来这是由于对样本的列进行了聚类导致的

因为聚类，将相似的样本就放在一起了，所以样本顺序发生了变化，我们可以看到热图上方的聚类树，这就是聚类的情况

在这里插入图片描述
解决办法：画图的时候关掉对列样本进行聚类的功能,如下设置：
Heatmap函数中添加参数cluster_cols=F 即可

library(p
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