
计算生物
weixin_43364556
这个作者很懒,什么都没留下…
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解决rstoolbox解析silent文件报错 chain, numbers = x.split(“:“),ValueError: too many values to unpack
背景1.利用snugdock生成多个pdb结构之后,将所有的pdb文件计算各种打分值之后转化为silent文件,此时发现rstoolbox读取silent文件中的参数时报错报错内容>>> rf.io.parse_rosetta_file("model1_pred_deepab_aligned_0001.silent",rules)Traceback (most recent call last): File "<stdin>", line 1, in <m.原创 2022-03-02 15:06:05 · 231 阅读 · 0 评论 -
pymol配体平移与旋转
背景目标:检测两个不同蛋白的相对位置情况下对接的准确度,因此需要平移和旋转配体蛋白操作步骤旋转和平移将配体和受体保存为两个object选择配体–>drag matrix按下shift+鼠标左键可以完成配体的旋转按下shift+按下鼠标中间的滑轮可以实现平移注:如果操作之后不起作用再来一遍。...原创 2022-03-01 17:15:13 · 5077 阅读 · 0 评论 -
解决conda安装pymol报错
背景:系统环境:windows10问题情况:利用pymol官网提供的conda安装命令行安装之后发现报错(报错内容在正文),命令行如下conda install -c schrodinger pymol-bundle执行pymol报错内容Traceback (most recent call last): File "F:\softwares\software_install\anaconda\envs\pymol\lib\runpy.py", line 183, in _run_mod.原创 2022-02-26 11:56:19 · 1529 阅读 · 0 评论