利用visnetwork绘制网络图

首先安装和加载visnetwork包

install.packages(‘visNetwork’)
library('visNetwork')

文件准备如下：

链接：https://pan.baidu.com/s/1NHu05wtdrlPK3iBF8c5dug 
提取码：xkdl 

网络图设计的逻辑是这样的：

目的：利用网络图直观显示OTU和序列长度（nbase）分布的关系，验证各组OTU的差异是不由序列长度差异导致

图形样式：分为2类OTU和nbase，连接线从nbase到OTU。

plot的信息放在nodes文件中

nodes$id，OTU和nbase放在同一列中，名称要唯一

nodes$group，分为OTU和nbase两类，程序默认的给这两类分配两种颜色

nodes$size，plot的大小，我们用来表示某一OTU序列数占总序列数的比例，值的大小不要超过70（？）

node$shape,用来表示不同类型（OTU, nbase）

连接的信息放在link文件中

links$from, 连线的开端，本例中用nbase

links$to,连线的末端，本例中用OTU

links$type,连线的类型，本例用hyperlink

links$color,连线的颜色，本例表示处理分组

links$width，连线的宽度，本例用来表示OTU序列数量占某一组中的比例

准备好这两个文件，运行以下内容

visNetwork(nodes,links)

图像不好看，因为数据没关联