weixin_42480153的博客

ZOTU表处理方法参见本人前述zotu流程1 OUT表准备用excel打开文件zotutab.vsearch.count_table，第一列列名改为#NAME，第二列删除 文件另存为csv格式文件2 准备meta文件Excel新建一个表格，第一列是样品名，第二列是处理分组信息，文件另存为csv格式3 准备物种注释文件用Excel打开zotus1.nr_v138.wang.taxonomy,选中第二列，替换，查找内容输入(*)，点全部替换选...

在论文中发现了这么一张图，我们准备用ggplot来做下这个图首先，数据准备好，做长型的用以下代码就可以出图了mydata<-read.table("clipboard",sep="\t",header=T)mydata$Module<-factor(mydata$Module,levels = c("M23","M22","M21","M20","M19","M18","M17","M16","M15","M14","M13","M12","M11","M10","M..

1：初级桑吉图1.1作图目的连接两个堆叠柱形图，利用分支线来说明两个柱形之间量化的关系。1.2数据准备创建如图所示表格，Method为左柱形图准备，TAX为右柱形图准备，量化关系是序列数。首先新建rowtype，全命名为1，再把数据复制一遍，新复制的rowtype列全赋值49。其他的列后面用到，本文不用1.2图形构成由2个堆叠柱形图，一个logistic曲线构成。曲...

首先安装和加载visnetwork包install.packages(‘visNetwork’)library('visNetwork')文件准备如下：链接：https://pan.baidu.com/s/1NHu05wtdrlPK3iBF8c5dug 提取码：xkdl 网络图设计的逻辑是这样的：目的：利用网络图直观显示OTU和序列长度（nbase）分布的关系，验证各组...