生信-序列比较dp[未完成]

 

 

来自：生物信息学-陈铭第二版的一个例题。

题目：

目前的代码，运行不正确，关键就是不知道怎么回溯啊，回溯怎么标记呢？

 

#include <iostream>
#include<vector>
using namespace std;

vector<char> s1,t1;//在回溯的时候使用
string s,t;//输入两个字符串
int dp[30][30];
int maxs(int x,int y,int z){
    if(x>=y&&x>=z)return x;
    else if(y>=x&&y>=z)return y;
    else return z;
}
void dfs(int len1,int len2){
    //递归出口
    if(len1==0||len2==0){//这里有一个问题就是另一个没放完怎么办？我要的是全部的。
         //如果有一个其中没放完，那么接着放。
         if(len1!=0){//如果s1没放完那么
            for(int i=len1-1;i>=0;i--){
                s1.push_back(s[i]);
                t1.push_back('-');
            }
         }
         if(len2!=0){
            for(int i=len2-1;i>=0;i--){
                s1.push_back('-');
                t1.push_back(t[i]);
            }
         }

        //打印s1,t1。
        for(int i=s1.size()-1;i>=0;i--)
            cout<<s1[i]<<" ";
        cout<<"\n";
        for(int i=t1.size()-1;i>=0;i--)
            cout<<t1[i]<<" ";
        cout<<"\n\n";
        return ;
    }

    //先求出左上、上、下三者中最大的值
    int m=maxs(dp[len1-1][len2-1],dp[len1-1][len2],dp[len1][len2-1]);
    if(dp[len1-1][len2-1]==m){//如果这样的话，那么就将二者push进来
        s1.push_back(s[len1-1]);
        t1.push_back(t[len2-1]);
        dfs(len1-1,len2-1);
        s1.pop_back();t1.pop_back();
    }
    if(dp[len1-1][len2]==m){
        s1.push_back(s[len1-1]);
        t1.push_back('-');
        dfs(len1-1,len2);
        s1.pop_back();t1.pop_back();
    }
    if(dp[len1][len2-1]==m){
        s1.push_back('-');
        t1.push_back(t[len2-1]);
        dfs(len1,len2-1);
        s1.pop_back();t1.pop_back();
    }
}

int main() {

    cin>>s>>t;
    int len1=s.size();
    int len2=t.size();
    int x,y,z;
    for(int i=0;i<=len1;i++){
        for(int j=0;j<=len2;j++){
            if(i==0&&j==0){
                dp[i][j]=0;continue;
            }
//            if(i==0||j==0){//这么写是不对的，因为不知道是哪个插入了多少空格。
//                dp[i][j]=-1;continue;
//            }
            if(i==0){//相当于在s中一直插入-。
                dp[i][j]=dp[i][j-1]-1;continue;
            }
            if(j==0){
                dp[i][j]=dp[i-1][j]-1;continue;
            }
            x=dp[i][j-1]-1;//在t中插入空格
            y=dp[i-1][j-1]+(s[i-1]==t[j-1]?2:-1);//比较两者是否相同，相同+2，否则-1
            z=dp[i-1][j]-1;//在s中插入空格
            dp[i][j]=maxs(x,y,z);
        }//在计算y时，一开始没有加上三元表达式的括号，导致计算错误。
    }
    //下面是怎么回溯找到解呢？？？
    for(int i=0;i<=len1;i++){
        for(int j=0;j<=len2;j++){
            cout<<dp[i][j];
            if(dp[i][j]<0)cout<<" ";
            else cout<<"  ";
        }
        cout<<"\n";
    }
    dfs(len1,len2);
    return 0;
}
/**
acgctg
catgt
**/

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目前的运行结果：

 

dp矩阵是正确的但是回溯结果不对，还是编程能力有限，先思考着，有解了再过来。 

转载于:https://www.cnblogs.com/BlueBlueSea/p/9694802.html